Распространение путей свободного окисления дыхательных субстратов и регуляция их экспрессии в митохондриях высших растений
Диссертация
Нами было показано, что у растений с пониженной активностью ротенон-нечувствительных NADH дегидрогеназ важную роль может играть разобщение дыхания и окислительного фосфорилирования за счёт рассеивания трансмембранного потенциала. Митохондриальные разобщающие белки обнаружены у многих растений, грибов и простейших. Их функционирование играет важную роль в процессе созревания плодов, адаптации… Читать ещё >
Содержание
- 1. Обзор литературы
- 1. 1. Механизмы снижения внутриклеточной концентрации 14 кислорода
- 1. 2. Феномен свободного окисления
- 1. 3. Разобщённое дыхание как способ свободного окисления
- 1. 3. 1. Термогенин бурого жира млекопитающих
- 1. 3. 2. Растительный разобщающий митохондриальный белок
- 1. 3. 3. Разобщённое дыхание и ATP/ADP-антипортер
- 1. 4. Молекулярные механизмы несопряжённого дыхания
- 1. 4. 1. NAD (P)H:xhhoh оксидоредуктазы типа II
- 1. 4. 1. 1. Распространённость ротенон-нечувствительных 30 N AD (P)H-дегидроген аз
- 1. 4. 1. 2. Классификация ротенон-нечувствительных 32 ЫАО (Р)Н-дегидрогеназ
- 1. 4. 1. 3. Первичная структура ротенон-нечувствительных 34 КАЭ (Р)Н-дегидрогеназ
- 1. 4. 1. 4. Взаимодействие хинонов с NAD (P)H- 38 дегидрогеназами типа II
- 1. 4. 1. 5. Экспрессионная регуляция ротенон- 39 нечувствительных КАО (Р)Н-дегидрогеназ
- 1. 4. 1. 6. Физиологическая роль МАО (Р)Н-дегидрогеназ типа II
- 1. 4. 1. 7. Терапевтические аспекты ротенон- 42 нечувствительных ЫАБ (Р)Н-дегидрогеназ
- 1. 4. 2. Альтернативная оксидаза
- 1. 4. 2. 1. Строение альтернативной оксидазы
- 1. 4. 2. 2. Регуляция активности альтернативной оксидазы
- 1. 4. 2. 3. Функции альтернативного пути
- 1. 4. 2. 4. Роль Альтернативной оксидазы в патогенезе
- 1. 4. 1. NAD (P)H:xhhoh оксидоредуктазы типа II
- 2. 1. Цели и задачи
- 2. 2. Объекты и методы исследования
- 2. 2. 1. Объекты исследования
- 2. 2. 2. Постановка эксперимента по созданию светового 60 режима
- 2. 2. 3. Выделение растительных митохондрий
- 2. 2. 4. Определение количества белка
- 2. 2. 5. Определение активности ферментов
- 2. 2. 6. Очистка ПАЯК-дегидрогеназы
- 2. 2. 7. Выделение суммарной клеточной популяции РНК
- 2. 2. 8. Обратная транскрипция
- 2. 2. 9. Проведение полимеразной цепной реакции
- 2. 2. 10. Количественный ПЦР-анализ
- 2. 2. 11. Определение уровня экспрессии генов
- 2. 2. 12. Секвенирование ПЦР-продукта
- 2. 2. 13. Компьютерные методы анализа 68 2.2.14 Определение мембранного потенциала растительных митохондрий
- 2. 2. 15. Статистическая обработка данных
- 2. 3. Результаты и их обсуждение
- 2. 3. 1. Распространённость внешних ротенон- 70 нечувствительных NADH-дегидрогеназ
- 2. 3. 2. Особенности окисления NAD-зависимых субстратов в 72 эндосперме клещевины
- 2. 3. 3. Идентификация и клонирование гена внешней ротеноннечувствительных NADH-дегидрогеназы томата
- 2. 3. 4. Идентификация и клонирование гена внутренней 83 ротенон-нечувствительной NADH-дегидрогеназы томата
- 2. 3. 5. Тканевая локализация внешней ротенон- 87 нечувствительных NADH-дегидрогеназы томата
- 2. 3. 6. Органоспецифическая экспрессия гена внешней 90 ротенон-нечувствительных NADH-дегидрогеназы томата
- 2. 3. 7. Влияние света на активность внешней ротенон- 93 нечувствительных NADH-дегидрогеназы
- 2. 3. 8. Световая регуляция экспрессии генов путей свободного 95 окисления томата
- 2. 3. 9. Влияние красного света на активность внешней 105 ротенон-нечувствительных NADH-дегидрогеназы
- 2. 3. 10. Регуляция экспрессии внешней ротенон- 109 нечувствительных NADH-дегидрогеназы светом различных длин
- 2. 3. 11. Разобщающий эффект лауриновой кислоты
Список литературы
- Ершова А.Н. Метаболическая адаптация растений к гипоксии и повышенному содержанию диоксида углерода / А. Н. Ершова. -Воронеж: Изд-во Воронеж, гос. ун-та, 2007. 264 с.
- Игамбердиев А.У. Окисление сукцината в глиоксисомах щитка кукурузы / А. У. Игамбердиев, Б. Ф. Иванов, М. И. Родионова // Физиология растений. 1990. — т.37, №.3.- стр. 505−510.
- Игамбердиев А.У. Роль реакций переаминирования в метаболизме сукцината в эндосперме проростков клещевины / А. У. Игамбердиев, В. Н. Попов // Физиология растений. 1996. — т. 43. № 4. — с. 548−553.
- Лакин Г. Ф. Биометрия / Г. Ф. Лакин. Москва: Высш. шк., 1990. -351с.
- Скулачев В.П. Нефосфорилирующее дыхание как механизм, предотвращающий образование активных форм кислорода /В.П. Скулачев // Молекулярная биология. 1995. — Т. 29, № 6. — с. 1199−1209.
- Скулачев В.П. Снижение внутриклеточной концентрации Ог как особая функция дыхательных систем клетки /В.П. Скулачев // Биохимия. -1994.-т. 59, № 12.-с. 1910−1912.
- A critique of the use of inhibitors to estimate partitioning of electrons between mitochondrial respiratoiy pathways in plant / A.H. Millar et al. // Physiologia Plantarum. 1995. — vol. 95. — pp. 523−532.
- A plant cold-induced uncoupling protein / M. Laloi et al. // Nature. 1997.- vol. 389. pp. 135−136.
- A single amino acid change in the plant alternative oxidase alters the specificity of organic acid activation /I. Djajanegara et al. // FEBS Letters.- 1999.-vol. 454.-pp. 220−224.
- Acidianus ambivalens type-II NADH-dehydrogenase: genetic characterization and identification of the flavin moiety as FMN / T.M. Bandeiras et al. //FEBS Lett. 2002. — vol. 531. — pp. 273−277.
- Akerman K.E.O. Safranine as a probe of the mitochondrial membrane potential / K.E.O. Akerman, M.K.F. Wikstrom // FEBS Lett. 1976. — vol. 68.-pp. 191−197.
- Alternative oxidase in Durham wheat mitochondria. Activation by pyruvate, hydroxypyruvate and glyoxylate and physiological role / D. Pastore et al. // Plant and Cell Physiology. 2001. — vol. 42. — pp. 1373−1382.
- Analysis of respiratory chain regulation in roots of soybean seedlings / A.H. Millar et al. // Plant Physiology. 1998. — vol. 117. — pp. 1083−1093.
- Annonacin, a lipophilic inhibitor of mitochondrial complex I, induces nigral and striatal neurodegeneration in rats: possible relevance for atypical parkinsonism in Guadeloupe / P. Champy et al. // J Neurochem. 2004.-vol. 88, No. l.-pp. 63−69.
- Arabidopsis genes encoding mitochondrial type II NAD (P)H dehydrogenases have different evolutionary origin and show distinct responses to light / A.M. Michalecka et al. // Plant Physiol. 2003. — vol. 133.-pp. 642−652.
- AtPUMP: an Arabidopsis gene encoding a plant uncoupling mitochondrifa protein / I.G. Maia et al. // FEBS Lett. 1998. — vol. 429. — pp. 403−406.
- Avila-Adame C. Disruption of the alternative oxidase gene in Magnaporthe grisea and its impact on host infection / C. Avila-Adame, W. Koller // Mol Plant Microbe Interact. 2002. — vol. 15, No. 5. — pp. 493−500.
- Blackburn P. Ribonuclease inhibitor from human placenta: interaction with derivatives of ribonuclease A / P. Blackburn, B.L. Jailkhani // J Biol Chem. -1979.-vol. 254.-pp. 12 488−93.
- Boveris A. The mitochondrial ggeneration and hydrogen peroxide. General properties and effect of hyperbaric oxygen /А. Boveris, B. Chance // Biochem. J. 1973. — vol. 134. — pp. 707−716.
- Breitkreuz K.E. Subcellular compartmentation of the 4-aminobutyrate shunt in protoplasts from developing soybean cotyledons / K.E. Breitkreuz, B.J. Shelp//Plant Physiol. 1995.-vol. 108, No. l.-pp. 99−103.
- Burge C. Prediction of complete gene structures in human genomic DNA / C. Burge, S. Karlin // J. Mol. Biol. 1997. — vol. 268. — pp. 78−94.
- Carneiro P. The main external NAD (P)H dehydrogenase of Neurospora crassa mitochondria /Р. Carneiro, M. Duarte, A. Videira // Biophys Acta. -2004.-vol. 1608.-pp. 45−52.
- Characteristics of the aerobic respiratory chains of the microaerophiles Campylobacter jejuni and Helicobacter pylori / M.A. Smith et al. // Arch. Microbiol. 2000. — vol. 174, No. 1−2. — pp. 1−10.
- Characterization of mitochondrial alternative NAD (P)H dehydrogenases in arabidopsis: intraorganelle location and expression / D. Elhafez et al. // Plant Cell Physiol. 2006. — vol. 47, No. 1. — pp. 43−54.
- Characterization of Neurospora crassa mitochondria prepared with a grind-mill / H. Weiss et al. // Eur J Biochem. 1970. — vol. 14. — pp. 75−82.
- Chaudhuri M. Trypanosome alternative oxidase is regulated post-transcriptionally at the level of RNA stability / M. Chaudhuri, R. Sharan, G.C. Hill // J Eukaryot Microbiol. 2002. — vol. 49, No. 4. — pp. 263−269.
- Chomczynski P. Single-step method of RNA isolation by acid guanidinium thiocyanate-phenol-chloroform extraction extraction /Р. Chomczynski, N. Sacchi // Anal. Biochem. 1987. — vol. 162. — pp. 156−159.
- Cloning of an additional cDNA for the alternative oxidase in tobacco / J. Whelan et al. //Plant Physiology. 1995. — vol. 107. — pp.1469−1470.
- CLUSTAL W: improving the sensitivity of progressivemultiple sequence alignment through sequence weighting, position-specific gap penalties andweight matrix choice / D. Higgins et al. // Nucleic Acids Res. 1994. — vol. 22. — pp. 4673−4680.
- Cold stress decreases the capacity for respiratory NADH oxidation in potato leaves / A.S. Svensson et al. // FEBS Lett. 2002. — vol. 517. — pp. 79−82.
- Cottingham I.M. Partial purification and properties of the external NADH dehydrogenase from cuckoo-pint {Arum maculatum) mitochondria /I.M. Cottingham, A.L. Moore //Biochem J. -1984. vol. 224. — pp. 171−179.
- Cyanide-insensitive respiration in thermogenic flowers of Victoria and Nelumbo / H. Skubatz et al. // Journal of Experimental Botany. 1990. -vol. 41.-pp. 1335−1339.
- Cytochrome and alternative respiratory pathways compete for electrons in the presence of pyruvate in soybean mitochondria /M.H.N. Hoefnagel et al. // Archives of Biochemistry and Biophysics. 1995. — vol. 318. — pp. 394 400.
- Dawson A.G. Oxidation of cytosolic NADH formed during aerobic metabolism in mammalian cells / A.G. Dawson // Trends Biochem Sci. -1979.-vol. 4.-pp. 171−176.
- Differential expression of the multigene family encoding the Soybean mitochondrial alternative oxidase / P.M. Finnegan et al,. // Plant Physiology. 1997. — vol. 114. — pp. 455−466.
- Effect of carboxyatractylate on transmembrane electrical potencial of plant mitochondria in different metabolic states /F. Macri et al. // Biochem Md Biol Int. 1994. — vol. 34. — pp. 217−224.
- Electron partitioning between the cytochrome and alternative pathways in plant mitochondria / M. Ribas-Carbo et al. // Plant Physiology. 1995. -vol. 109. — pp. 829−837.
- Enhanced expression and activation of the alternative oxidase during infection of Arabidopsis with Pseudomonas syringae pv tomato / B.H. Simons et al. // Plant Physiology. 1999. — vol. 120. — pp. 529−538.
- Fait A. GAB A shunt deficiencies and accumulation of reactive oxygen intermediates: insight from Arabidopsis mutants / A. Fait, A. Yellin, H. Fromm //FEBS Lett. -2005. vol. 579, No. 2. — pp. 415−420.
- Fang J. Alternative oxidase present in procyclic Trypanosoma bricei may act to lower the mitochondrial production of superoxide / J. Fang, D.S. Beattie // Arch Biochem Biophys. 2003. — vol. 414, No. 2. — pp. 294−302.
- Fang J. External alternative NADH dehydrogenase of Saccharomyces cerevisie: a potential source of superoxide / J. Fang, D.S. Beattie // Free Radic Biol Med. 2003. — vol. 34. — pp. 478−488.
- Fatty acids as acute regulation of the proton conductance of hamster brown fat mitochondria / R.M. Locke et al. // Eur J Biochem. -1982. vol. 129. -pp. 373−380.
- Fatty acids cycling mechanism and mitochondrial uncoupling proteins / P. Jezek et al. // Biochm et Biophys Acta. 1998. — vol. 1365. — pp. 319−327.
- Felsenstein J. PHYLIP Phylogeny Inference Package (Version 3.2) / J. Felsenstein // Cladistics. — 1989. — vol. 5. — pp. 164−166.
- Finel M. Does NADH play a central role in energy metabolism in Helicobacter pyloril / M. Finel // Trends Biochem Sci. 1998. — vol. 23. -pp. 412−413.
- First evidence and characterization of an uncoupling protein in fungi kingdom: CpUCP of Candida parapsilosis /W. Jarmuszkiewicz et al. // FEBS Letters. 2000. — vol. 467. — pp. 145−149.
- Fisher N. A motif for quinine binding sites in respiratory and photosynthetic systems / N. Fisher, P.R. Rich // J Mol Biol. 2000. — vol. 296. — pp. 11 531 162.
- Free fatty acids regulate the uncoupling and altermative oxidase activities in plant mitochondria / F.E. Sluse et al. // FEBS Lett. 1998. — vol. 433. — pp. 237- 240.
- Functional reconstitution of Arabidopsis thaliana plant uncoupling mitochondrial protein (AtPUMPl) expressed in Escherichia coli /J. Borecky et al II FEBS Letters. 2001. — vol. 505. — pp. 240−244.
- Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search /S.F. Altschul et al. // Nucleic Acids Res. 1997. — vol. 25. — pp. 3389−3402.
- Gomes C.M. A new type-II NADH dehydrogenase from the archaeon Acidianus ambivalens: characterization and in vitro reconstitution of respiratory chain / C.M. Gomes, T.M. Bandeiras, M. Teixeira // J Bioenerg Biomembr. 2001. — vol. 33. — pp. 1−8.
- Growth inhibition of bloodstream forms of Trypanosoma brucei by the iron vhelator deferoxamine / T. Breidbach et al. // Int J Parasitol. 2002. — vol. 32, No. 4.-pp. 473−479.
- Heat generation and dissipation in plants: can the alternative oxidative phosphorylation pathway serve a thermoregulatory role in plant tissues other than specialized organs? /R.W. Breidenbach et al. // Plant Physiology. -1997.-vol. 114.-pp. 1137−1140.
- High-efficiency cloning of full-length cDNA- construction and screening of cDNA expression libraries for mammalian cells / H. Okayama et al. // Methods Enzymol. 1987. — vol. 154. — pp. 3−28.
- Hollenberg C.P. The glutamate dehydrogenases of yeast: extra-mitochondrial enzymes / C.P. Hollenberg, W.F. Riks, P. Borst // Biochim Biophys Acta. 1970. — vol. 201. — pp. 13−9.
- Homologues of yeast and bacterial rotenone-insensitive NADH dehydrogenases in higher eukaryotes: two enzymes are present in potato mitochondria /A.G. Rasmusson et al. // Plant J. 1999. — vol. 20. — pp. 7987.
- Housekeeping gene selection for real-time RT-PCR normalization in potato during biotic and abiotic stress / N. Nicot et al. // Journal of Experimental Botany. 2005. — vol. 56, No. 421. — pp. 2907−2914.
- Huh W.K. Characterization of the gene family encoding alternative oxidase from Candida albicans / W.K. Huh, S.O. Kang // Biochem J. 2001. — vol. 356, No. 2.-pp. 595−604.
- Hydrogen peroxide generation by higher plant mitochondria oxidizing complex I or complex II substrates /Е. Braidot et al. // FEBS Lett. -1999. -vol. 451.-pp. 347−350.
- Identification of a mitochondrial external NADPH dehydrogenase by overexpression in transgenic Nicotiana sylvestris / A.M. Michalecka et al. // Plant J. 2004. — vol. 37. — pp. 415−425.
- Identification of AtNDIl, an internal non-phosphorylating NAD (P)H dehydrogenase in arabidopsis mitochondria / C.S. Moore et al. // Plant Physiology. 2003. — vol. 133. — pp. 1968−1978.
- In vivo complementation of complex I by the yeast Ndil enzyme. Possible application for treatment of Parkinson disease / B.B. Seo et al. // J Biol Chem.-2006.-vol. 281, No. 20.-pp. 14 250−14 255.
- Jezek P. Evidence for Anion-translocating Plant Uncoupling Mitachondrial Protein in potato mitochondria /Р. Jezek, A.D.T. Costa, A.E. Vercesi // J Biol Chem. 1996. — vol. 271. — pp. 32 743−32 748.
- Kita K. Parasite mitochondria as drug target: diversity and dynamic changes during the life cycle / K. Kita, C. Nihei, E. Tomitsuka // Curr Med Chem. -2003. vol. 10, No. 23. — pp. 2535−2548.
- Kowaltowski A. J. Activation of the potato plant uncoupling mitochondrial protein inhibits reactive oxygen species gtntration by the respiratory chain / A.J. Kowaltowski, A.D.T. Costa, A.E. Vercesi // FEBS Lett. 1998. — vol. 425.-pp. 213−216.
- Light regulation of the arabidopsis respiratory chain. Multiple discrete photoreceptors responses contribute to induction of type II NAD (P)H dehydrogenases genes / M.A. Escobar et al. // Plant Physiol. 2004. — vol. 136.-pp. 2710−2721.
- Livak K.J. Analysis of relative gene expression data using real-time quantitative PCR and the 2"AACt method / K.J. Livak, T.D. Schmittgen // Methods. 2001. — vol. 25. — pp. 402−408.
- Locke R.M. A re-evolution of the role of fatty acids in the physiological regulation of the proton conductance of hamster brown adipose tissue mitochondria / R.M. Locke, D.G. Nicholls // FEBS Lett. 1981. — vol. 135. -pp. 249−252.
- Marsh P.B. Respiration and fermentation in the carrot, Daucus carota- I Respiration / P.B. Marsh, D.R. Goddard // American Journal of Botany. -1939. vol. 26. — pp. 724−728.
- Mcintosh L. Molecular biology of the alternative oxidase / L. Mcintosh // Plant Physiology. 1994. — vol. 105, No. 3. — pp.781−786.
- Meeuse B.J.D. Thermogenic respiration in aroids / B.J.D. Meeuse // Annual Reviews of Plant Physiology. 1975. — vol. 26. — pp. 117−126.
- Melo A.M.P. New insights into type-II NAD (P)H:quinine oxidoreductases / A.M.P. Melo, T.M. Bandeiras, M. Teixeira // Microb and Mol Biol Rev. -2004. vol. 68, No. 4. — pp. 603−616.
- Melo A.M.P. Primary structure and characterization of 64 kDa NADH dehydrogenase from the inner membrane of Neurospora crassa mitochondria / A.M.P. Melo, M. Duarte, A. Videira // Biochim Biophys Acta. 1999. — vol. 1412. — pp. 282−287.
- Menz R.I. Identification and characterization of an inducible NAD (P)H dehydrogenase from red beetroot mitochondria / R.I. Menz, D.A. Day // Plant Physiol. 1996. — vol. 112. — pp. 607−613.
- Menz R.I. Purification and characterization of a 43-kDa rotenone-insensitive NADH dehydrogenase from plant mitochondria / R.I. Menz, D.A. Day // J Biol Chemb. 1996. — vol. 271. — pp. 23 117−23 120.
- Millar A.N. Regulation of Alternative Oxidase Activity by Pyruvate in Soybean Mitochondria / A.N. Millar, FJ. Bergersen, D.A. Day // Plant Physiol. Biochem. 1994. — vol. 32. — pp. 847−852.
- Millhouse J. Control of the citric acid cycle in mitochondria from germinating castor bean endosperm / J. Millhouse, J.T. Wiskich // Plant Science. 1986. — vol. 46, No. 1. — pp. 15−19.
- Mitochondrial disease: a historical, biochemical, and London perspective / J.M. Land et al. //Neurochem Res. 2004. — vol. 29. — pp. 483−491.
- Mitochondrial succinic-semialdehyde dehydrogenase of the gamma-aminobutyrate shunt is required to restrict levels of reactive oxygen intermediates in plants / N. Bouche et al. // Proc Natl Acad Sci USA. -2003. vol. 100, No. 11. — pp. 6843−6848.
- Molecular aspects of structure-function relationships in mitochondrial adenine nucleotide carrier / P.V. Vignais et al. // Structure and properties of cell membranes. 1985. — vol. 11. — pp. 139−179.
- Molecular pathophysiology of Parkinson’s disease / D.J. Moore et al. // Annu Rev Neurosci. 2005. — vol. 28. — pp. 57−87.
- Moller I.M. A new dawn for plant mitochondrial NAD (P)H dehydrogenases / I.M. Moller // Trends Plant Sci. 2002. — vol. 7. — pp. 235−237.
- Moller I.M. Binding and screening by cations and the effect on exogenous NAD (P)H oxidation in Neurospora crassa mitochondria / I.M. Moller, J.-P. Schwitzguebel, J.M. Palmer // Eur J Biochem. 1982. — vol. 123. — pp. 8188.
- Moller I.M. NAD (P)H-ubiquinone oxidoreductases in plant mitochondria / I.M. Moller, A.G. Rasmusson, K.M. Fredlund // J Bioenerg Biomembr. -1993.-vol. 25. pp. 377−384.
- Moller I.M. Plant mitochondria and oxidative stress: electron transport, NADPH turnover, and metabolism of reactive oxygen species / I.M. Moller // Annual Reviews of Plant Physiology and Plant Molecular Biology. 2001. -vol. 52.-pp. 561−591.
- Mullis K.B. Specific synthesis of DNA in vitro via a polymerase-catalyzed chain reaction / K.B. Mullis, F.A. Faloona // Methods Enzymol. 1987. -vol.155, — pp. 335−350.
- NADH dehydrogenases: from basic science to biomedicine / T. Yagi et al. //J Bioenerg Biomembr. 2001. — vol. 33, No. 3. — pp. 233−242.
- New insight into the regulation of plant succinate dehydrogenase / C. Affourtit et al. //J. Biol. Chem.- 2001. vol. 276. — pp 32 567−32 574.
- Nicholls D. G. Thermogenic techanisms in brown fat / D.G. Nicholls, R.M. Locke // Physiol Revues. 1984. — vol. 64. — pp. 1−64.
- Nihei C. Trypanosome alternative oxidase as a target of chemotherapy / C. Nihei, Y. Fukai, K. Kita // Biochem Biophys Acta. 2002. — vol. 1587, No. 2−3. — pp. 234−239.
- Organic acid activation of the alternative oxidase of plant minochondria / A.H. Millar et al. //FEBS Letters. 1993. — vol. 329. — pp. 259−262.
- Palmieri F. Mitochondrial carrier proteins / F. Palmieri // FEBS Lett. 1995. — vol. 346. — pp. 48−54.
- Popov V.N. Possible role of free oxidation processes in the regulation of reactive oxygen species production in plant mitochondria / V.N. Popov // Biochem. Soc. Trans. 2003.- vol. 31. — pp. 1316−1317.
- Presymptomatic visualization of plant-virus interactions by thermography /L. Chaerle et al. //Nature Biotechnology. 1999. — vol. 17. — pp. 813−816.
- Primary structure and import pathway of the rotenone-insensitive NADH-ubiquinone oxidoreductase of mitochondria from Saccharomyces cerevisiae /S. De Vries et al. // Eur J Biochem. 1992. — vol. 203. — pp. 587−592.
- Promper C. The role of the proton-pumping and alternative respiratory chain NADH: ubiquinone oxidoreductases in overflow catabolism of Aspergillus niger / C. Promper, R. Schneider, H. Weiss // Eur J Biochem, -1993. vol. 216.- pp. 223−30.
- Protein measurement with the folin pihend reagent / O.H. Lowry et al. // J. Biol. Chem. 1951. — vol. 193. — pp. 265−275.
- PUMPingplants /А.Е. Vercesi et al. //Nature. 1995. — vol. 375. — pp. 24.
- Purvis A.C. Does the alternative pathway ameliorate chilling injury in sensitive plant tissues? / A.C. Purvis, R.L. Shewfelt // Physiologia Plantarum. 1993. — vol. 88. — pp. 712−718.
- Purvis A.C. Reduction of superoxide production by mitochondria oxidizing NADH in the presence of organic acids / A.C. Purvis // Journal of Plant Physiology. 2001. — vol. 158. — pp. 159−165.
- Regulation of the alternative oxidase activity in six wild monocotyledonous species- an in vivo study at the whole root level / F.F. Millenaar et al. // Plant Physiology. 2001. — vol. 126. — pp. 376−387.
- Regulation of the cyanide-resistant alternative oxidase of plant mitochondria / D.M. Rhoads et al. // The Journal of Biological Chemistry. -1998. vol. 273. — pp. 30 750−30 756.
- Respiratory chains from aerobic thermophilic / M.M. Pereira et al. // J Bioenerg Biomembr. 2004. — vol. 36. — pp. 93−105.
- Roberts Т.Н. Direct evidence for the presence of two external NAD (P)H dehydrogenases coupled to the electron transport chain in plant mitochondria / T. H Roberts, K.M. Fredlund, I.M. Moller // FEBS Lett. -1995.-vol. 373.-pp. 307−309.
- Role of alternative oxidase in pathogenesis of Cryptococcus neoformans / S. Akhter // Infect Immun. 2003. — vol. 71, No. 10. — pp. 5794−5802.
- Rottenberg H. Fatty acid uncoupling of oxidative phosphorylation in rat liver mitochondrial / H. Rottenberg, K. Hachimoto // Biochem. 1986. — vol. 25.-pp. 1747−1755.
- Rozen S. Primer3 on the WWW for general users and for biologist programmers / S. Rozen, H. Skaletsky // Methods Mol. Biol. 2000. — vol. 132. — pp. 365−386.
- Salicylic acid enhances the activity of the alternative pathway of respiration in tobacco leaves and induces thermogenicity / D. Van der Straeten et al. // Plant. 1995. — vol. 196. — pp. 412−419.
- Satya Narayan V. The 4-aminobutyrate shunt in Solanum tuberosum / V. Satya Narayan, P.M. Nair // Phytochemistry. 1986. — vol. 25, No. 5. — pp. 997−1001.
- Satya Narayan V., Nair PM (1990) Metabolism, enzymology and possible roles of 4-aminobutyrate in higher plants / V. Satya Narayan, P.M. Nair // Phytochemistry. 1990. — vol. 29, No. 2. — pp. 367−375.
- Saviani E. E. Fatty acid-mediated uncoupling of potato tuber mitochondria / E.E. Saviani, I.S. Martins // Biochem. Mol. Biol. Int. 1998. — vol. 44. — pp. 833−839.
- Scandalios J.G. Oxygen stress and superoxide dismutase / J.G. Scandalios // Plant Physiology. 1993. — vol. 101. — pp. 7−12.
- Schonfeld P. Does the role of ADP/ATP- antiporter in the uncoupling effect of fatty acids depend on the mitochondria type? / P. Schonfeld // FEBS Lett.- 1992.- vol. 303.-pp. 190−192.
- Skubatz H. Oscillatory, heat-production in male cones of cycads / H. Skubatz, W. Tang, B.J.D. Meeuse // Journal of Experimental Botany. -1 993.- vol. 44. pp. 489−492.
- Skulachev V. P. Anion carriers in fatty acid-mediated physiological uncoupling / V.P. Skulachev // J. Bioenerg. Biomembr. 1999. — vol. 31. -pp. 431−445.
- Skulachev V. P. Fatty acid circuit as a physiological mechanism of uncoupling of oxidative phosphorylation / V.P. Skulachev // FEBS Lett. -1991.-vol. 294.-pp. 158−162.
- Skulachev V. P. Uncoupling: new approaches to an old problem of bioenergetics / V.P. Skulachev // Biochim et Biophys Asta. 1998. — vol. 1363.-pp. 100−124.
- Skulachev V.P. Role of uncoupled and non-coupled oxidations in maintenance of safely low levels of oxygen and its one-electron reductants /
- V.P. Skulachev // Quarterly Reviews of Biophysics. 1996. — vol. 29. — pp. 169−202.
- Specificity of the organic acid activation of alternative oxidase in plant mitochondria / A.H. Millar et al. // Plant Physiiology. 1996. — vol. 111.-pp. 613−618.
- Stitt M. Pyrophosphate as an energy donor in the cytosol of plant cells: an enigmatic alternative to ATP / M. Stitt // Botanica Acta. 1998. — vol. 111.-pp. 167−175.
- Stress-induced co-expression of alternative respiratory chain components in Arabidopsis thaliana / R. Clifton et al. // Plant Mol Biol. 2005. — vol. 58. -pp. 193−212.
- Stryer L. Biochemistry / L. Stryer. N.Y.: Freeman. — 1995. — 1064 p.
- Svensson A.S. Light-dependent gene expression for proteins in the respiratory chain of potato leaves / A.S. Svensson, A.G. Rasmusson // Plant J.-2001.-vol. 28.-pp. 73−82.
- The acute regulation of mitochondrial proton conductance in cell and mitochondria Prom the brown fat of cold-adapted and warm-adapted guinea-pigs /R.M. Locke et al. // Eur J Biochem. 1983. — vol. 129. — pp. 381−387.
- The alternative oxidase in roots of Poa annua after transfer from high-light to low-light conditions /*F.F. Millenaar et al. // Plant Journal. 2000. — vol. 23. — pp. 623−632.
- The ATP/ADP-antiporter is involved in the uncoupling effect of fatty acids on mitochondria /A.Yu. Andreyev et al. // Eur. J. Biochem. 1989. — vol. 182. — pp. 585−592.
- The cyanide-resistant oxidase: To inhibit or not to inhibit, that is the question / D.A. Day et al. // Plant Physiology. 1996. — vol. 110. — pp. 1−2.
- The external calcium-dependent NADH dehydrogenase from Neurospora crassa mitochondria / A.N.P. Melo et al. // The Journal of Biological Chemistry. 2001. — vol. 276. — pp. 3947−3951.
- The internal alternative NADH dehydrogenase of Neurospora crassa /М. Duarte et al. // Biochem J. 2003. — vol. 71. — pp. 1005−1011.
- The internal rotenone-insensitive NADPH dehydrogenase contributes to malate oxidation by potato tuber and pea leaf mitochondria /S.C. Agius et al. //Physiologia Plantarum. 1998. — vol. 104. — pp 329−336.
- The respiratory chain of the thermophilic archaeon Sulfolobus metallicus: studies on the type-II NADH dehydrogenase / T.M. Bandeiras et al. //Biochim Biophys Acta. 2003. — vol. 1557. — pp. 13−19.
- The role of alternative oxidase in modulating carbon use efficiency and growth during macronutrient stress in tobacco cells / S.M. Sieger et al. // J Exp Bot. 2005. — vol. 56. — pp. 1499−1515.
- The role of mild uncoupling and non-coupled respiration in the regulation of hydrogen peroxide generation by pland mitochondria /V. Casolo et al. // FEBS Lett. 2000. — vol. 274. — pp. 53−57.
- The role of the alternative oxidase in stabilizing the in vivo reduction state of ubiquinone pool- and the activation state of the alternative oxidase / F.F. Millenaar et al. // Plant Physiology. 1998. — vol. 118. — pp. 599−607.
- The Saccharomyces cerevisiae NDE1 and NDE2 genes encode separate mitochondrial NADH dehydrogenases catalyzing the oxidation of cytosolic NADH / M.A.H. Luttik et al. // The Journal of Biological Chemistry. -1998. vol. 273. — pp. 24 529−24 534.
- Umbach A.L. Covalent and noncovalent dimmers of the cyanide-resistant alternative oxidase protein in higher plant mitochondria and their relationship to enzyme activity / A.L. Umbach, J.N. d Siedow // Plant Physiology. 1993. — vol. 103. — pp. 845−854.
- Umbach A.L. Regulation of alternative oxidase kinetics by pyruvate and intermolecular disulfide bond redox status in soybean seedling mitochondria / A.L. Umbach, J.T. Wiskich, J.N. Siedow // FEBS Letters. 1994. — vol. 348.-pp. 181−184.
- Van Herk A.W.H. Die chemischen Vorgange im Sauromatum-Kolben / A.W.H. Van Herk // Receuil des Botaniqiues Neerlandais. 1937. — vol. 34. -pp. 69−156.
- Vanlerberghe G.C. ALTERNATIVE OXIDASE: from gene to function / G.C. Vanlerberghe, L. Mcintosh // Annu Rev Plant Physiol Plant Mol Biol. -1997.-vol. 48.-pp. 703−734.
- Vanlerberghe G.C. Mitochondrial electron transport regulation of nuclear gene expression. Studies with the alternative oxidase gene of tobacco / G.C. Vanlerberghe, L. Mcintosh // Plant Physiology. 1994. — vol. 105. — pp. 867 874.
- Vanlerberghe G.C. Molecular localization of a redox-modulated process regulating plant mitochondrial electron transport / G.C. Vanlerberghe, L. Mcintosh, J.Y.H. Yip//The Plant Cell. 1998. — vol. 10. — pp. 1551−1560.
- Wagner A.M. Alternative oxidase: its possible role / A.M. Wagner, A. Moore // Bioscience Reports. 1997. — vol. 17. — pp. 319−333.
- Wagner A.M. Measurements of in vivo ubiquinone reduction levels in plant cells / A.M. Wagner, M.J. Wagner // Plant Physiology. 1995. — vol. 108. -pp. 277−283.
- Wagner A.M. The alternative respiration pathway in plants: Role and regulation / A.M. Wagner, K. Krab // Physiologia Plantarum. 1995. — vol. 95.-pp. 318−325.
- Whelan J. Sequencing of a soybean alternative oxidase cDNA clone / J. Whelan, L. Mcintosh, D.A. Day // Plant Physiology. 1993. — vol. 103. — pp. 1481.
- Wierenga R.K. Preddiction of the occurrence of the ADP-binding beta alpha beta-fold in proteins, using an amino acid sequence fingerprint / R.K. Wierenga, P. Terpstra, W.G. Hoi // J Mol Biol. 1986. — vol. 187. — pp. 101 107.
- Winkler E. Effect of fatty acids on H+transport activity of the reconstituted uncoupling protein / E. Winkler, M. Klingenberg // J Biol Chem. -1994. -vol. 269.-pp. 2508- 2515.
- Yagi T. Bacterial NADH-quinone oxidoreductases / T. Yagi // J Bioenerg Bioomembr. 1991. — vol. 23. — pp. 211−225.
- Zottini M. Oxidation of external NAD (P)H by mitochondria from taproots and tissue cultures of sugar beet {Beta vulgaris) / M. Zottini, G. Mandolino, D. Zannoni // Plant Physiol. 1993. — vol. 102. — pp. 579−585.1501. БЛАГОДАРНОСТИ
- Автор хотел бы выразить благодарность тем людям, которые помогали ему, и без которых эта работа никогда бы не вышла в свет.
- В первую очередь я выражаю слова признательности своим дорогим и любимым родителям. Огромное им спасибо за их бесконечное терпение, поддержку, любовь и заботу.
- Я благодарю моего научного руководителя, Попова Василия Николаевича, за его ценные советы по планированию экспериментов, обработке полученных результатов и за его бесконечный оптимизм, вселяющий надежду на успех.
- Я также признателен заведующему кафедрой физиологии и биохимии растений ВГУ Епринцеву Александру Трофимовичу за общее руководство моим проектом и помощь в обеспечении материальной базы исследования.
- Хочется выразить признательность Елене Николаевне Моховой и Ольге Марковой, открывшим для меня удивительный мир растительной биоэнергетики.
- Я благодарен Егору Борисовичу Прохорчуку за ценные консультации по стратегии планирования, проведения и интерпретации результатов количественного ПЦР-анализа.
- Отдельное спасибо Константину Петровичу Пенскому за оказанную помощь в издании автореферата.
- Также хочу сказать спасибо всем моим друзьям, которые всегда подставляли мне плечо и оказывали поддержку в минуты отчаянья.1. Олег Фоменко.