Репликация. 
Базовый репликон

Репликационный цикл ДНК плазмид, как и хромо-сомной, состоит из инициации, элонгации и терминации.

При удвоении ДНК плазмид образуется ковалентно закрытые, но не сверхскрученные, молекулы, которые затем конвертируются в молекулы сверхспирализованной ДНК. Процесс элонгации непрерывен. Для завершения цикла удвоения необходимо, что бы первичная элонгационная вилка достигла терминуса, а вторая начала движение от O-пункта в противоположном направлении вплоть до терминуса.

Все, что в настоящее время известно о репликации плазмид, выяснено, в основном, в ходе изучения так называемых мини-плазмид или мини-репликонов, конструируемых с помощью рестриктаз и лигазы из нормальных плазмид или введением в геномы плазмид транспозонов, вызывающих перестройки в плазмидной ДНК.

Для репликации плазмиды минимально необходима лишь часть плазмиды — базовый репликон. Наиболее полно он изучен на примере миниплазмиды F. Он в ней состоит из ряда элементов:

О-пункт — специфическая последовательность нуклеотидов, на которой происходит инициация репликации. У некоторых плазмид несколько O-пунктов (гены ori).

Структурный ген для позитивной функции (ген rep).

Детерминанты, негативно контролирующие количество плазмид (cop).

Детерминанты, обеспечивающие, распростране-ние копий (par).

Детерминанты ccd.

Что, касается гена rep, то предполагают, что он контролирует инициацию репликации. Посредством про-дукции белка rep E, связывающегося с ori.

С другой стороны, предполагается существование и другой схема, контроля копийности.

Найдено 5 прямых повторов, родственных повторам в локусе ori, формирующих локус cop. Считают, что cop конкурирует с локусом ori за связывание белка repE, который обладает авторепрессорной активностью. Предполагается, что он имеет две формы, одна из которых имеет значение в инициации репликации, вторая — в репрессии гена rep (авторепрессорная активность).

Репликация плазмиды F и всех, происходящих от нее, мини-репликонов требует участия белка, кодируемого хромосомным геном dnaA и являющегося инициатором репликации бактериальной хромосомы.

Для плазмиды F характерно наличие двух O-пунктов репликации — oriS и oriV. С oriS репликация проходит в двух противоположных направлениях, тогда как с oriV — только в одном.

У большинства остальных плазмид репликация проходит по сходным схемам, с определенными отличиями, так существенные отличия наблюдаются при репликации P-подобных плазмид.