X-вирус шалота. 
Экспрессия белка ТБГ3 Х-вируса шалота

Геном ShVX представлен одноцепочечной РНК, состоящей из 8890 нуклеотидов, не считая 3'-концевого поли-A (Kanyuka et al. 1992). Геном вируса содержит 6 ОРС, 3'- и 5'-концевые нетранслируемые области и некодирующие участки между 1 и 2, 3 и 4 а также между 4 и 5 ORF (Kanyuka et al., 1992) (рис. 2).

Длина 5'-концевого нетранслируемого участка составляет 98 нуклеотдидов, а 3'-концевого — 112 нуклеотидов, за которыми следует поли-А хвост.

ОРС1 кодирует 195К белок, содержащий 1718 аминокислотных остатков. Этот белок содержит три домена, гомологичных соответственно метилтрансферазе, хеликазе и РНК-полимеразе potex-, carlaи tymoviruses (Kanyuka et al., 1992). Таким образом, ORF1 кодирует вирус-специфичную РНК-репликазу, которая, согласно множественному выравниванию (Kanyuka et al., 1992), эволюционно близка к РНК-репликазе потексвирусов (рис. 3).

Рис. 2. Схема геномной РНК ShVX. Обозначения: ORF — открытая рамка трансляции, MT — метилтрансферазный домен, HEL — хеликазный домен, POL — полимеразный домен, Р1, P2, P3 — ТБГ1, ТБГ2 и ТБГ3 соответственно. СР — ген капсидного белка, Cys — ген цистеин-богатого белка.

Рис. 3. Множественное выравнивание трех доменов в составе продукта трансляции ОРС1

ОРС2 и ОРС3 белка ShVX перекрываются и кодируют два белка, гомологичных белкам ТБГТБГ1 и ТБГ2 соответственно, характерных для carlaи potexvirus.

Интересно, что геном ShVX содержит последовательность между ОРС3 и ОРС4 (рис. 2), гомологичную ТБГ3 carlaи potexвирусов (Kanyuka et al., 1992), однако, эта последовательность лишена стартового кодона AUG.

ОРС4 кодирует 42К белок, для которого не было найдено гомологов среди всех организмов, однако, он характерен для всех вирусов рода Allexivirus (Kanyuka et al. 1992, S. Sumi et al.1993, S. Sumi et al. 1999).

ОРС5 представляет собой последовательность, кодирующую КБ ShVX, родственный КБ вирусов родов Сarlavirus и Potexvirus (Kanyuka et al. 1992). Шестая открытая рамка трансляции кодирует цистеин-богатый белок. (Haylor et al., 1990; Levay & Zavriev, 1991).