ΠΏΠΎΠ»ΠΈΠΌΠΎΡΡΠ½ΡΠΉ ΠΌΠ°ΡΠΊΠ΅Ρ Π°ΡΡΠ΅ΡΠΈΠ°Π»ΡΠ½ΡΠΉ Π³ΠΈΠΏΠ΅ΡΡΠ΅Π½Π·ΠΈΡ Π ΡΠ°Π±ΠΎΡΠ΅ ΠΈΡΠΏΠΎΠ»ΡΠ·ΠΎΠ²Π°Π½Ρ ΠΎΠ±ΡΠ°Π·ΡΡ ΠΊΡΠΎΠ²ΠΈ 261 Π΄ΠΎΠ½ΠΎΡΠ° Π±Π΅Π· ΠΊΠ»ΠΈΠ½ΠΈΡΠ΅ΡΠΊΠΈΡ
ΠΏΡΠΎΡΠ²Π»Π΅Π½ΠΈΠΉ ΠΈ Π΄ΠΈΠ°Π³Π½ΠΎΠ·ΠΎΠ² ΠΠΠ ΠΈ ΠΠΠ‘ (ΠΊΠΎΠ½ΡΡΠΎΠ»ΡΠ½Π°Ρ Π³ΡΡΠΏΠΏΠ°), 233 ΠΎΠ±ΡΠ°Π·ΡΠ° ΠΊΡΠΎΠ²ΠΈ Π±ΠΎΠ»ΡΠ½ΡΡ
Ρ Π΄ΠΈΠ°Π³Π½ΠΎΠ·ΠΎΠΌ ΠΠΠ ΠΈ 226 ΠΎΠ±ΡΠ°Π·ΡΠΎΠ² ΠΊΡΠΎΠ²ΠΈ Π±ΠΎΠ»ΡΠ½ΡΡ
Ρ Π΄ΠΈΠ°Π³Π½ΠΎΠ·ΠΎΠΌ ΠΠΠ‘. ΠΠΈΠ°Π³Π½ΠΎΠ·Ρ ΠΠΠ ΠΈ ΠΠΠ‘ ΡΡΡΠ°Π½Π°Π²Π»ΠΈΠ²Π°Π»ΠΈ Π² ΡΠΎΠΎΡΠ²Π΅ΡΡΡΠ²ΠΈΠΈ ΠΈ Ρ ΡΡΡΡΠΎΠΌ ΠΊΠ»ΠΈΠ½ΠΈΡΠ΅ΡΠΊΠΈΡ
ΡΠ΅ΠΊΠΎΠΌΠ΅Π½Π΄Π°ΡΠΈΠΉ ΠΠΠΠ. Π‘ΡΠ΅Π΄Π½ΠΈΠΉ Π²ΠΎΠ·ΡΠ°ΡΡ ΠΏΠ°ΡΠΈΠ΅Π½ΡΠΎΠ² Ρ Π΄ΠΈΠ°Π³Π½ΠΎΠ·ΠΎΠΌ ΠΠΠ ΡΠΎΡΡΠ°Π²Π»ΡΠ» 59,4±14,1 Π»Π΅Ρ, Ρ Π΄ΠΈΠ°Π³Π½ΠΎΠ·ΠΎΠΌ ΠΠΠ‘ — 61,8±13,6 Π³ΠΎΠ΄Π°. Π‘ΡΠ΅Π΄Π½ΠΈΠΉ Π²ΠΎΠ·ΡΠ°ΡΡ Π»ΡΠ΄Π΅ΠΉ ΠΈΠ· ΠΊΠΎΠ½ΡΡΠΎΠ»ΡΠ½ΠΎΠΉ Π³ΡΡΠΏΠΏΡ ΡΠΎΡΡΠ°Π²Π»ΡΠ» 55,0±17,4 Π³ΠΎΠ΄Π°. ΠΠΠ Π²ΡΠ΄Π΅Π»ΡΠ»ΠΈ ΠΈΠ· 200 ΠΌΠΊΠ» Π²Π΅Π½ΠΎΠ·Π½ΠΎΠΉ ΠΊΡΠΎΠ²ΠΈ ΠΏΠ°ΡΠΈΠ΅Π½ΡΠΎΠ² Ρ ΠΏΠΎΠΌΠΎΡΡΡ Π½Π°Π±ΠΎΡΠ° Π΄Π»Ρ Π²ΡΠ΄Π΅Π»Π΅Π½ΠΈΡ Π³Π΅Π½ΠΎΠΌΠ½ΠΎΠΉ ΠΠΠ AxyPrep Blood Genomic DNA Miniprep Kit («Axygen», Π‘Π¨Π) ΡΠΎΠ³Π»Π°ΡΠ½ΠΎ ΠΈΠ½ΡΡΡΡΠΊΡΠΈΡΠΌ ΠΏΡΠΎΠΈΠ·Π²ΠΎΠ΄ΠΈΡΠ΅Π»Ρ.
Π£ΡΠ°ΡΡΠΎΠΊ Π³Π΅Π½Π° Π‘LOCK, ΡΠΎΠ΄Π΅ΡΠΆΠ°ΡΠΈΠΉ ΠΌΠ°ΡΠΊΠ΅Ρ 3111Π’C, Π°ΠΌΠΏΠ»ΠΈΡΠΈΡΠΈΡΠΎΠ²Π°Π»ΠΈ ΠΌΠ΅ΡΠΎΠ΄ΠΎΠΌ ΠΏΠΎΠ»ΠΈΠΌΠ΅ΡΠ°Π·Π½ΠΎΠΉ ΡΠ΅ΠΏΠ½ΠΎΠΉ ΡΠ΅Π°ΠΊΡΠΈΠΈ (ΠΠ¦Π ) ΡΠΎ ΡΠ»Π΅Π΄ΡΡΡΠΈΠΌΠΈ ΠΏΡΠ°ΠΉΠΌΠ΅ΡΠ°ΠΌΠΈ: ΠΏΡΡΠΌΠΎΠΉ 5'-tccagcagtttcatgagatgc-3', ΠΎΠ±ΡΠ°ΡΠ½ΡΠΉ 5'-gaggtcatttcatagctgagc-3' («Π‘ΠΈΠ½ΡΠΎΠ»», Π ΠΎΡΡΠΈΡ) [Desan et al., 2000]. Π‘ΠΌΠ΅ΡΡ Π΄Π»Ρ Π°ΠΌΠΏΠ»ΠΈΡΠΈΠΊΠ°ΡΠΈΠΈ ΡΠΎΠ΄Π΅ΡΠΆΠ°Π»Π° ΠΏΠΎ 10 ΠΏΠ ΠΊΠ°ΠΆΠ΄ΠΎΠ³ΠΎ ΠΈΠ· ΠΏΡΠ°ΠΉΠΌΠ΅ΡΠΎΠ², 2ΠΌΠΊΠ» 10Π§ΠΠ¦Π Π±ΡΡΠ΅ΡΠ°, 1 ΠΌΠ ΠΊΠ°ΠΆΠ΄ΠΎΠ³ΠΎ dNTP ΠΈ 0.5 Π΅Π΄. Taq-ΠΏΠΎΠ»ΠΈΠΌΠ΅ΡΠ°Π·Ρ («Π‘ΠΈΠ»Π΅ΠΊΡ», Π ΠΎΡΡΠΈΡ). ΠΠ¦Π ΠΏΡΠΎΠ²ΠΎΠ΄ΠΈΠ»ΠΈ Π½Π° ΠΏΡΠΈΠ±ΠΎΡΠ΅ Robocycler («Stratagene», Π‘Π¨Π) ΠΏΠΎ ΠΏΡΠΎΠ³ΡΠ°ΠΌΠΌΠ΅: 3 ΠΌΠΈΠ½ Π΄Π΅Π½Π°ΡΡΡΠ°ΡΠΈΡ ΠΏΡΠΈ 94 Β°C, Π° Π·Π°ΡΠ΅ΠΌ 35 ΠΏΠΎΠ²ΡΠΎΡΡΡΡΠΈΡ
ΡΡ ΡΠΈΠΊΠ»ΠΎΠ² Π² ΡΠ΅ΠΆΠΈΠΌΠ΅: 94 Β°C — 1 ΠΌΠΈΠ½, 59 Β°C -1 ΠΌΠΈΠ½, 72 Β°C — 1ΠΌΠΈΠ½. ΠΠΎΠ»ΡΡΠ΅Π½Π½ΡΠΉ ΠΠ¦Π ΠΏΡΠΎΠ΄ΡΠΊΡ (220 ΠΏ.Π½.) ΠΏΠΎΠ΄Π²Π΅ΡΠ³Π°Π»ΠΈ ΠΎΠ±ΡΠ°Π±ΠΎΡΠΊΠ΅ ΡΠ΅ΡΡΡΠΈΠΊΡΠ°Π·ΠΎΠΉ MhlI («Π‘ΠΈΠ±ΡΠ½Π·ΠΈΠΌ», Π ΠΎΡΡΠΈΡ) Π΄Π»Ρ ΠΈΠ΄Π΅Π½ΡΠΈΡΠΈΠΊΠ°ΡΠΈΠΈ Π°Π»Π»Π΅Π»Π΅ΠΉ T (220 ΠΏ.Π½.) ΠΈ C (125 ΠΈ 95 ΠΏ.Π½.) (ΡΠΈΡ. 1). Π£ΡΠ»ΠΎΠ²ΠΈΡ ΠΏΡΠΎΠ²Π΅Π΄Π΅Π½ΠΈΡ ΠΠ¦Π ΠΈ ΡΠ΅ΡΡΡΠΈΠΊΡΠΈΠΈ ΠΎΠΏΠΈΡΠ°Π½Ρ ΡΠ°Π½Π΅Π΅ [Desan et al., 2000].
Π£ΡΠ°ΡΡΠΎΠΊ Π³Π΅Π½Π° Π‘LOCK, ΡΠΎΠ΄Π΅ΡΠΆΠ°ΡΠΈΠΉ ΠΌΠ°ΡΠΊΠ΅Ρ 843Π’Π‘, Π°ΠΌΠΏΠ»ΠΈΡΠΈΡΠΈΡΠΎΠ²Π°Π»ΠΈ ΡΠΎ ΡΠ»Π΅Π΄ΡΡΡΠΈΠΌΠΈ ΠΏΡΠ°ΠΉΠΌΠ΅ΡΠ°ΠΌΠΈ: ΠΏΡΡΠΌΠΎΠΉ 5'- atttatcaggctttcaaggtca-3', ΠΎΠ±ΡΠ°ΡΠ½ΡΠΉ 5'-atgggagtccaggatttatt-3' («Π‘ΠΈΠ½ΡΠΎΠ»», Π ΠΎΡΡΠΈΡ). ΠΡΠ°ΠΉΠΌΠ΅ΡΡ ΡΠΊΠΎΠ½ΡΡΡΡΠΈΡΠΎΠ²Π°Π½Ρ Ρ ΠΏΠΎΠΌΠΎΡΡΡ ΠΏΡΠΎΠ³ΡΠ°ΠΌΠΌΡ Primer Premier 5. Π‘ΠΌΠ΅ΡΡ Π΄Π»Ρ Π°ΠΌΠΏΠ»ΠΈΡΠΈΠΊΠ°ΡΠΈΠΈ ΡΠΎΠ΄Π΅ΡΠΆΠ°Π»Π° ΠΏΠΎ 10 ΠΏΠ ΠΊΠ°ΠΆΠ΄ΠΎΠ³ΠΎ ΠΈΠ· ΠΏΡΠ°ΠΉΠΌΠ΅ΡΠΎΠ², 2ΠΌΠΊΠ» 10Π§ΠΠ¦Π Π±ΡΡΠ΅ΡΠ°, 1 ΠΌΠ ΠΊΠ°ΠΆΠ΄ΠΎΠ³ΠΎ dNTP ΠΈ 0.5 Π΅Π΄. Taq-ΠΏΠΎΠ»ΠΈΠΌΠ΅ΡΠ°Π·Ρ («Π‘ΠΈΠ»Π΅ΠΊΡ», Π ΠΎΡΡΠΈΡ). ΠΠ¦Π ΠΏΡΠΎΠ²ΠΎΠ΄ΠΈΠ»ΠΈ Π½Π° ΠΏΡΠΈΠ±ΠΎΡΠ΅ Robocycler («Stratagene», Π‘Π¨Π) ΠΏΠΎ ΠΏΡΠΎΠ³ΡΠ°ΠΌΠΌΠ΅: 3 ΠΌΠΈΠ½ Π΄Π΅Π½Π°ΡΡΡΠ°ΡΠΈΡ ΠΏΡΠΈ 94 Β°C, Π° Π·Π°ΡΠ΅ΠΌ 35 ΠΏΠΎΠ²ΡΠΎΡΡΡΡΠΈΡ
ΡΡ ΡΠΈΠΊΠ»ΠΎΠ² Π² ΡΠ΅ΠΆΠΈΠΌΠ΅: 94 Β°C — 1 ΠΌΠΈΠ½, 62 Β°C -1 ΠΌΠΈΠ½, 72 Β°C — 1ΠΌΠΈΠ½. ΠΠΎΠ»ΡΡΠ΅Π½Π½ΡΠΉ ΠΠ¦Π ΠΏΡΠΎΠ΄ΡΠΊΡ (575 ΠΏ.Π½.) ΠΏΠΎΠ΄Π²Π΅ΡΠ³Π°Π»ΠΈ ΠΎΠ±ΡΠ°Π±ΠΎΡΠΊΠ΅ ΡΠ΅ΡΡΡΠΈΠΊΡΠ°Π·ΠΎΠΉ RsaI («Π‘ΠΈΠ±ΡΠ½Π·ΠΈΠΌ», Π ΠΎΡΡΠΈΡ) Π΄Π»Ρ ΠΈΠ΄Π΅Π½ΡΠΈΡΠΈΠΊΠ°ΡΠΈΠΈ Π°Π»Π»Π΅Π»Π΅ΠΉ T (427 ΠΈ 156 ΠΏ.Π½.) ΠΈ C (295, 132 ΠΈ 156 ΠΏ.Π½.) (ΡΠΈΡ. 2).
ΠΡΠΎΠ΄ΡΠΊΡΡ ΡΠ΅ΡΡΡΠΈΠΊΡΠΈΠΈ ΡΠ°Π·Π΄Π΅Π»ΡΠ»ΠΈ Π² 6%-Π½ΠΎΠΌ ΠΏΠΎΠ»ΠΈΠ°ΠΊΡΠΈΠ»Π°ΠΌΠΈΠ΄Π½ΠΎΠΌ Π³Π΅Π»Π΅, ΠΎΠΊΡΠ°ΡΠ΅Π½Π½ΠΎΠΌ Π±ΡΠΎΠΌΠΈΡΡΡΠΌ ΡΡΠΈΠ΄ΠΈΠ΅ΠΌ, ΠΈ Π²ΠΈΠ·ΡΠ°Π»ΠΈΠ·ΠΈΡΠΎΠ²Π°Π»ΠΈ Ρ ΠΏΠΎΠΌΠΎΡΡΡ ΡΠΈΡΡΠ΅ΠΌΡ Kodak EDAS 290 («Kodak», Π‘Π¨Π). Π‘ΡΠ°ΡΠΈΡΡΠΈΡΠ΅ΡΠΊΠΈΠΉ Π°Π½Π°Π»ΠΈΠ· Π΄Π°Π½Π½ΡΡ
ΠΎΡΡΡΠ΅ΡΡΠ²Π»ΡΠ»ΠΈ Ρ ΠΏΠΎΠΌΠΎΡΡΡ ΠΏΠ°ΠΊΠ΅ΡΠ° ΠΏΡΠΎΠ³ΡΠ°ΠΌΠΌ MS Excel. ΠΠΎΡΡΠΎΠ²Π΅ΡΠ½ΠΎΡΡΡ ΡΠ°Π·Π»ΠΈΡΠΈΠΉ ΡΠ°ΡΡΠΎΡ Π°Π»Π»Π΅Π»Π΅ΠΉ ΠΈ Π³Π΅Π½ΠΎΡΠΈΠΏΠΎΠ² Π² Π³ΡΡΠΏΠΏΠ°Ρ
ΠΎΡΠ΅Π½ΠΈΠ²Π°Π»ΠΈ Ρ ΠΏΠΎΠΌΠΎΡΡΡ ΠΊΡΠΈΡΠ΅ΡΠΈΡ Ρ2. ΠΠΎΡΡΠΎΠ²Π΅ΡΠ½ΡΠΌ ΡΡΠΈΡΠ°Π»ΠΈ ΡΡΠΎΠ²Π΅Π½Ρ Π·Π½Π°ΡΠΈΠΌΠΎΡΡΠΈ p < 0.05. ΠΠ»Ρ ΠΎΡΠ΅Π½ΠΊΠΈ ΡΠΈΡΠΊΠ° Π·Π°Π±ΠΎΠ»Π΅Π²Π°Π½ΠΈΡ ΡΠ°ΡΡΡΠΈΡΡΠ²Π°Π»ΠΈ ΡΠΎΠΎΡΠ½ΠΎΡΠ΅Π½ΠΈΠ΅ ΡΠ°Π½ΡΠΎΠ² OR.