Database Project' - обеспечивает информацией касательно рибосомы, включая анализ данных online, филогенетические деревья по рРНК, выравненные и аннотированные последовательности рРНК.
HIV-SD — the 'HIV Sequence Database' собирает, курирует и аннотирует ДНК последовательности HIV и SIV; обеспечивает различными инструментами по анализу этих данных.
IMGT — the 'ImMunoGeneTics database' - специализируется на имуноглобулинах, Т-клеточных рецепторах и главном комплексе гистосовместимости (MHC) всех видов позвоночных.
TRANSFAC — содержит данные по ДНК транскрипционных факторов и связывающих их участков.
EPD — the 'Eukaryotic Promoter Database' - аннотированная коллекция эукариотических POL II промоторов, для которых экспериментально определен стартовый сайт транскрипции.
GOBASE специализированная база по геномам органелл.
Геномные
Геномные базы значительно различаются по форме и содержанию. Для наиболее важных и интересных с точки зрения генетики организмов существуют опубликованные каталоги генов и мутаций в них. В последние годы многие каталоги переведены в электронную форму.
Кроме того, создано много новых баз отличающихся по подборке генов и способе представления информации.
Genomes Server / - доступ к геномам различных организмов.
Proteome Analysisбаза данных с упором на статистический и сравнительный анализ предсказанных протеомов полностью сиквенированных организмов.
Ensemblсовместный проект EBI и Wellcome Trust Sanger Institute, созданный с целью разработки системы, которая поддерживает автоматическое аннотирование больших эукариотических геномов. Представляет постоянно обновляемую базу с автоматическим аннотированием геномов многоклеточных.
Karyn’s Genomesпредоставляет общую информацию об организмах, чьи геномы полностью сиквенированы. Основная задача сервера — обеспечить лаконичное почему важен полный геном данного организма.
WormBase — хранилище информации по картированию, сиквенированию и фенотипам C. elegans и некоторых других нематод.
FlyBase — база для Drosophila melanogaster .
the 'Mouse Genome Database'.
RGD — the 'Rat Genome Database'.
SGD — the 'Saccharomyces Genome Database'.
MIPS база по геному дрожжей.
SPGP — 'S. Pombe Genome Project' основанный при Sanger Institute. База по грибку Schizosaccharomyces pombe.
AceDB — база по генетической информации Caenorhabditis elegans. Система управления этой базой очень популярна и легла в основу многих других баз данных. Одноименное название базы и системы управления базой AceDB привело к некоторой путанице среди баз данных по C.elegans.
HIV-SD mainpage. html) — 'HIV Sequence Database' собирает, курирует и аннотирует ДНК последовательности HIV и SIV.