Биологические базы данных и их виды

Биологические базы данных-это архивы согласованных данных, хранящихся в единой форме .Эти базы содержат данные широкого спектра разных Областей молекулярной биологии. Очень важно, что они, как правило, доступны через иинтернет и оснащены понятным интерфейсом для поиска информации.

Типы баз данных

• 1. Библиографические (MEDLINE)
• 2. Таксономические
• 3. Нуклеотидные
• 4. Нуклеотидные последовательности
• 5. Геномные
• 6. Белковые

Библиографические (MEDLINE)

Первичные или архивные базы данных содержат аннотированные первичные структуры ДНК и белков, пространственные структуры нуклеиновых кислот и белков, а также protein expression profiles — профили экспрессии генов белков клеток.

Вторичные (derived) базы данных содержат результаты анализов первичных источников, включая информацию о специфичных мотивах в последовательностях (sequence patterns and motifs), вариантах и мутациях, а также эволюционных связях. К этим же базам данных можно причислить и библиографические базы данных, такие как.

Medline.

Существуют интегрированные системы для получения всей необходимой информации относительно объекта исследования.

SRS (Sequence Retrieval System) http://srs.ebi.ac.uk/ является достаточно мощной системой запросов, существующей при Европейском Биоинформационном Институте EBI.

Обеспечивает информацией из болеечем 150 гетерогенных источников.