Оценка пластичности протеома плазмы крови здорового человека в экстремальных условиях жизнедеятельности
Диссертация
Было показано, что протеом плазмы крови здорового человека характеризуется достаточно высокой межиндивидуальной вариабельностью, в то время как внутрииндивидуальная вариабельность протеома здоровых добровольцев, изученная на протяжении 3-х недель в период обычной жизнедеятельности, лишь незначительно превышает техническую погрешность метода анализа. Коэффициент внутрииндивидуальной и групповой… Читать ещё >
Содержание
- 1. ВВЕДЕНИЕ
- 2. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
- 2. 1. Протеом крови человека
- 2. 2. Понятие «нормы» в протеомике и космической медицине
- 2. 3. Изучение белкового состава крови здорового человека при экстремальных условиях жизнедеятельности
- 2. 3. 1. Изменение белков крови после космических полетов
- 2. 3. 2. Изменение содержание белков в крови в ходе экспериментов по моделированию факторов космического полета
- 2. 3. 2. 1. Изменение белкового состава крови в условиях «сухой» иммерсии
- 2. 3. 2. 2. Изменение белкового состава крови в условиях длительной изоляции в гермообъекте
- 2. 4. Методы исследования протеома крови человека 30 2.4.1. Применение 2-БЕ для анализа протеома крови человека
- 2. 4. 1. 1. Изменения протеома плазмы (сыворотки) крови, выявленные методом 2-ЭЕ при патологических процессах
- 2. 4. 1. 2. Вариабельность протеома плазмы (сыворотки) крови здоровых людей, выявленная методом 2-ТУЕ
- 2. 5. Биоинформационные методы в протеомике и космической медицине
- 3. 1. Материалы исследования
- 3. 2. Объект исследования 50 3.2.1. Модельные эксперименты, включая анализ внутри- и межиндивидуальной вариабельности
- 3. 2. 1. 1. 7-суточная «сухая» иммерсия
- 3. 2. 1. 2. 105-суточная изоляция в гермообъекте
- 3. 2. 1. 3. Исследование внутрииндивидуальной вариабельности протеома плазмы крови
- 3. 2. 1. 4. Исследование межиндивидуальной вариабельности протеома плазмы крови
- 3. 3. Методы исследования
- 3. 3. 1. Получение образцов плазмы крови
- 3. 3. 2. Получение обедненной фракции плазмы крови
- 3. 3. 3. Разделение белков методом двумерного электрофореза
- 3. 3. 4. Получение и анализ изображения гелей
- 3. 3. 5. Анализ данных
- 3. 3. 5. 1. Расчет коэффициента вариации
- 3. 3. 5. 2. Кластерный анализ
- 3. 3. 5. 3. Статистический анализ
- 3. 3. 6. Идентификация белков методом масс-спектрометрического анализа пептидных фрагментов (РМР)
- 3. 3. 6. 1. Проведение гидролиза белков в геле
- 3. 3. 6. 2. Проведение масс-спектрометрического анализа
- 3. 3. 6. 3. Обработка масс-спектров
- 3. 3. 6. 4. Идентификация белков по базе данных
- 3. 3. 6. 5. Тандемный масс-спектрометрический анализ
- 4. 1. Протеомная карта плазмы крови здорового человека
- 4. 1. 1. Получение обедненной фракции образцов плазмы крови здоровых добровольцев
- 4. 1. 2. Анализ двумерных электрофореграмм
- 4. 1. 3. Оценка воспроизводимости анализа протеома плазмы крови здоровых добровольцев методом 2-ОЕ
- 4. 1. 4. Аннотирование мастер-геля
- 4. 2. Выявление белков с различающимся уровнем содержания, определяющих внутри- и межиндивидуальную вариабельность протеома плазмы крови здоровых людей
- 4. 2. 1. Внутрииндивидуальная вариабельность
- 4. 2. 2. Межиндивидуальная (групповая) вариабельность в норме
- 4. 3. Изменения протеома плазмы крови, вызванные воздействием модельных экспериментов
- 4. 3. 1. Эксперимент с 7-суточной «сухой» иммерсией с 105-суточной изоляцией в гермообъекте
- 4. 4. Сопоставление пластичности протеома плазмы крови с изменениями уровня содержания идентифицированных белков при патологии
Список литературы
- Алешкин В.А., Новикова Л. И., Лютов А. Г. и др. Белки острой фазы и их клиническое значение. // Клиническая медицина 1998. — № 8. — С. 39.
- Афонин Б.В. Состояние пищеварительной системы в длительных космических полетах и гипокинезии. // Российский журнал гастроэнтерологии, гепатологии, колопроктологии. — 1999. Т.9. -№ 7. — С.5.
- Афонин Б.В. Система пищеварения. Послеполетные клинико-физиологические исследования Орбитальная станция «Мир». // М.: Аником, 2001. Т. 1. — С. 620−628.
- Бабко А.К., Пилипенко А. Т. Фотометрический анализ. Т.1. Общие сведения и аппаратура. // М.: Химия, 1968 388 с.
- Баранов В.М., Демин Е. П., Степанов В. А. и др. Организационно-методические проблемы модельных экспериментов с длительной изоляцией в гермообъекте. Модельный эксперимент с длительной изоляцией: проблемы и достижения. // М.: Слово, 2001.-С. 5−20.
- Бокарев И.Н., Попова JI.B., Кондратьев Т. Б. Венозный тромбоэмболизм: лечение и профилактика // Consilium Medicum. Хирургия. 2005. — Т. 7. — № 1. — С. 44−52.
- Булатов М. И. Калинкин И. П. Практическое руководство по фотоколориметрическим и спектрофотометрическим методам анализа // Л.: Химия, 1976, — 176 с.
- Буравкова Л.Б., Ларина И. М., Попова И. А. Особенности метаболизма у человека при выполнении физической нагрузки после 7-суточной «сухой» иммерсии. // Физиология человека, 2003. Т.29. — № 5. — С. 82−89.
- Бутченко Л.А., Бутченко В. Л. К проблеме нормы в спортивной медицине. // Теория и практика физической культуры. — 1998. № 3. — С.
- Газенко О.Г., Григорьев А. И., Наточин Ю. В. Водно-солевой гомеостаз и невесомость. // Космическая биология и авиакосмическая медицина. 1980. — Т. 14. — № 5. — С. 3−10.
- О.Г. Газенко, И. И. Касьян. Физиологические проблемы невесомости// М, 1990.
- Герцик Ю.Г. Уровень сывороточных иммуноглобулинов и специфических IgE-антител при действии факторов космического полета и их моделировании. // Автореферат диссертации на соискание степени канд. биол. наук. Москва, 2004 -24 с.
- Говорун В. М, Арчаков А. И. Протеомные технологии в современной биомедицинской науке. // Биохимия. 2002. — Т.67. — № 10. — С. 1109−1123.
- Гоуфман Е. И, Мошковский С. А, Тихонова О. В. и др. Протеомное исследование термостабильной фракции сыворотки пациентов с различными опухолями с применением двумерного электрофореза. // Биохимия. 2006. — Т.71. — № 4. — С. 445−453.
- Григорьев А. И, Ларина И. М. Содержание соматотропина и других регуляторов мышечного метаболизма в крови человека при длительных космических полетах и гипокинезии. // Физиология человека. 1999. — Т.25. — № 4. — С. 89−96.
- Григорьев А. И, Баевский P.M. Концепция здоровья и проблема нормы в космической медицине. // М.: «Слово», 2001 96 с.
- Григорьев А. И, Баевский P.M. Концепция здоровья и космическая медицина. // М.: Слово, 2007 208 с.
- Гусева Е. В, Ташпулатов Р. Ю. Влияние 49-суточного космического полета на показатели иммунологической реактивности и белковый состав крови экипажа «Салют-5». // Космическая биология и авиакосмическая медицина. 1979. — Т. 13. -№ 1 — С. 3−8.
- Гусева Е. В, Ташпулатов Р. Ю. Изучение альбумин-глобулинового состава крови экипажа орбитальной станции «Салют-3». // Космическая биология и авиакосмическая медицина. 1979 -Т.13 — № 3 — С. 15−18.
- Гусева Е. В, Ташпулатов Р. Ю. Влияние полетов различной продолжительности на белковый состав крови космонавтов. // Космическая биология и авиакосмическая медицина. 1980.-Т. 14. -№ 1.~С. 13−17.
- Заболотская И. В, Маркин A.A. Липидный состав сыворотки крови человека в эксперименте с длительной изоляцией. Модельный эксперимент с длительной изоляцией: проблемы и достижения. // М.: Слово, 2001, 437−446.
- Каландаров С.К., Коршунова В. А., Проскурова Г. И. Влияние искусственной среды обитания гермообъектов на некоторые показатели обмена веществ у человека. // Космическая биология и авиакосмическая медицина. — 1986. Т. 20 — № 10. — С. 343−344.
- Козлов A.A., Беркович A.JL, Качалова Н. Д. и др. Пособие для врачей-лаборантов по методам исследования плазменного гемостаза. // М.: Российская академия медицинских наук, 2006. 24 с.
- Козловская И.Б. Фундаментальные и прикладные задачи иммерсионных исследований. // Авиакосмическая и экологическая медицина. 2008. — Т.42. — № 5. — С.3−7.
- Комаров Ф.И., Коровкин Б. Ф. Биохимические показатели в клинике внутренних болезней. // М.: Медпресс, 2000. 228 с.
- Константинова И.В., Антропова E.H., Мешков Д. О. и др. Иммунная резистентность человека в течение длительной изоляции. // Авиакосмическая и экологическая медицина. 1997. -Т.31. -№ 4. — С.57−60.
- Корнилова Л.Н., Темникова В. В., Алехина М. И. и др. Влияние продолжительной микрогравитации на вестибулярную функцию. // Авиакосмическая и экологическая медицина. 2006. -Т.40. — № 6. — С. 12−16.
- Корольков A.A. Диалектика и теоретическая медицина. // М.: Медицина, 1979. -235 с.
- Лакота Н.Г., Васин Ю. А., Ларина И. М., Демин Е. П. Термодинамическое состояние системы «организм человека замкнутая среда» при 240-суточной изоляции в гермообъеме. // Физиология человека. — 2002. — № 5. — С. 65−74.
- Лакота Н.Г., И.М. Ларина. Изучение температурного гомеостаза в реальной и моделируемой невесомости. // Физиология человека. 2002. — Т.28. — № 3. — С.102−112.
- Ларина И.М., Суханов Ю.В, Лакота Н. Г. Механизмы ранних реакций водно-электролитного обмена у человека в различных наземных моделях эффектов микрогравитации. // Авиакосмическая и экологическая медицина. 1999. — Т.ЗЗ. -№ 4.-С. 17−23.
- Ларина И.М. Гормональная регуляция. Послеполетные клинико-физиологические исследования. Орбитальная станция «Мир». // М.: Аником, 2001. Т. 1. — С.603−606.118
- Ларина О.Н. Белковый состав плазмы крови человека и животных при космических полетах и моделировании воздействия невесомости. // Диссертация на соискание степени канд. биол. наук. Москва, 1992 — 154 с.
- Ларина О.Н. Белковый состав плазмы крови космонавтов после длительных орбитальных полетов. // Космическая биология и авиакосмическая медицина. -1992.-Т.26. -№ 3. С. -67−69.
- Ларина О.Н. Влияние длительной изоляции в гермообъекте на состав электрофоретических фракций и содержание некоторых индивидуальных белков плазмы. // Авиакосмическая и экологическая медицина. 1997. — Т.31. — № 5. — С.45−54.
- Ларина О.Н. Воздействие факторов космического полета на продукцию белков, участвующих в адаптации' к измененным условиям среды. // Материалы конференции «Организм и окружающая среда: адаптация к экстремальным условиям». Москва, 2003. — С. 204.
- Ларина О.Н. Белки плазмы крови при длительных космических полетах. // Материалы XIII конференции1 по космической биологии и авиакосмической медицине, Москва, 2006. 13−16 июня — С. 167.
- Ларина О.Н., Беккер A.M. Исследование индивидуальных особенностей регуляции уровней белков крови при моделировании воздействия микрогравитации на человека. // Авиакосмическая и экологическая медицина. 2009. — Т.43. — № 1. — С. 52−56.
- Ларина О.Н., Беккер A.M., Умарходжаев P.M. Исследование показателей воспроизводимости метода двумерного электрофореза в ацетатцеллюлозе. // Технологии живых систем. 2006. — Т.З. — № 5−6. — С. 20−23.
- Лебедев К.А., Понякина И. Д., Авдеева B.C. Системное представление о спокойном и активном функционировании иммунной системы. // Успехи современной биологии. -1991. Т. 111.- № 2. — С. 229.
- Маркин A.A., Журавлева O.A. Биохимическое исследование крови. Послеполетные клинико-физиологические исследования Орбитальная станция «Мир». // М.: Аником, 2001. Т. 1. — С. 606−612.
- Маркин A.A., Журавлева O.A., Моруков Б. В. и др. Особенности обмена веществ у космонавтов после длительных полетов на международной космической станции. // Авиакосмическая и экологическая медицина. — 2005. Т.39. — № 4. — С. 36−41.
- Маркин A.A., Журавлева, O.A., Моруков Б. В. и др. Гомеостатические реакции организма человека при воздействии условий 105-суточной изоляции. // Авиакосмическая и экологическая медицина. 2010. — Т.44. — № 4. — С. 31−35.
- Маркин A.A., Моруков Б. В., Журавлева О. А. и др. Динамика биохимических показателей крови в эксперименте с 7-суточной «сухой» иммерсией. // Ависакосмическая и экологическая медицина. 2008. — Т.42. — № 5. — С. 56−60.
- Моруков Б.В., Ларина И. М., Григорьев А. И. Изменения обмена кальция и его регуляция у человека во время длительного космического полета. // Физиология человека. 1998. — Т.24. — № 2. — С. 102−107.
- Моруков Б.В., Носков В. Б., Ларина И. М. и др. Водно-солевой обмен и функция почек в космических полетах и наземных модельных экспериментах. // Российский физиологический журнал им. И. М. Сеченова. 2003. -Т.89. -№ 3. — С. 356−367.
- Моруков Б.В., Демин Е. П., Васильева Г. Ю. Эксперимент со 105-суточной изоляцией, моделирующий элементы межпланетной экспедиции к Марсу: задачи, объем и структура исследований. // Авиакосмическая и экологическая медицина. -2010.-Т.44.-№ 4.-С. 3−5.
- Носков В.Б. Состояние водно-солевого обмена. Послеполетные клинико-физиологические исследования Орбитальная станция «Мир». // М.: Аником, 2001. -Т. 1.-С. 599−603.
- Попов И.Г., Лацкевич A.A. Аминокислоты в крови космонавтов до и после 211-суточного полета. // Космическая биология и авиакосмическая медицина. 1984. -Т. 18. — № 2. — С. 26−33.
- Попова И.А., Ветрова Е. Г., Дроздова Т. Е. Активность ферментов сыворотки крови после длительных космических полетов. // Космическая биология и авиакосмическая медицина. 1984. — Т. 18. — № 5. — С. 81−82.
- Попова И.А., Ветрова Е. Г., Рустамьян Л. А. Оценка энергетического метаболизма космонавтов. // Физиолог. 1991. — Т.34 (1 Suppl). — С. 98−99.
- Поликарпов H.A., Рыкова М. П., Антропова E.H. и др. Некоторые наблюдения за состоянием иммунитет-микрофлора у членов экипажей в условиях эксперимента SFINCSS-99 в сопоставлении с параметрами гелиогеомагнитной активности.
- Модельный эксперимент с длительной изоляцией: проблемы и достижения. // М.: Слово, 2001.-С. 480−490.
- Ройтберг Г. Е., Струтынский А. Е. Лабораторная и инструментальная диагностика заболеваний внутренних органов. // М.: Бином, 1999. 622 с.
- Рыкова М.П., Антропова E.H., Мешков Д. О. Иммунологическое обследование. Послеполетные клинико-физиологические исследования Орбитальная станция «Мир». // М.: Аником, 2001. Т. 1. — С. 615−620.
- Рыкова М.П., Герцик Ю. Г., Антропова E.H. и др. Влияние длительной изоляции на формирование аллергических реакций у человека. // Авиакосмическая и экологическая медицина. 2004. — Т. 38. — № 2. — С. 24−28.
- Смирнов К.В. Пищеварение и гипокинезия. // М.: Медицина, 1990. 224 с:
- Фомин А.Н. Фибриноген крови при 7-суточной водной иммерсии и кратковременном космическом полете. // Космическая биология и авиакосмическая медицина. 1981. — Т.15. — № 5. — С. 83−85.
- Шенкман Б.С. Структурно-метаболическая пластичность скелетных мышц млекопитающих во время гипокинезии и невесомости. // Авиакосмическая и экологическая медицина. — 2002. Т.36. — № 3. — С. 3−14.
- Шмальгаузен И.И. Проблемы адаптации человека. // Вестник АМН СССР. 1975. -№ 10. -С. 5−16.
- Шульженко И.Б., Виль-Вильямс И.Ф. Возможность осуществления длительной водной иммерсии методом «сухой» иммерсии. // Космическая биология и авиакосмическая медицина. 1976. — Т. 10. — № 2. — С.32−34.
- Aebersold R., Mann М., Mass spectrometry-based proteomics. // Nature. 2003. -13−422(6928). — P. 198−207.
- Ahmed N., Barker G., Oliva K. et al. An approach to remove albumin for the proteomic analysis of low-abundance biomarkers in human serum. // Proteomics. 2003. — 3. P. 1980−1987.
- Ahmed N., Oliva K.T., Barker G. et al. Proteomic tracking of serum protein isoforms as screening biomarkers of ovarian cancer. // Proteomics. 2005. — 5(17). — P. 4625−4636.
- Aldred S., Sozzi T., Mudway I. Grant M.M. et al. Alpha tocopherol supplementation elevates plasma apolipoprotein Al isoforms in normal healthy subjects. // Proteomics. — 2006. Vol.6. — № 5. — P. 1695−703.
- Anderson L., Anderson N.G. High resolution two-dimensional electrophoresis of human plasma proteins. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1977. — 74(12). — P. 5421−5425.
- Anderson N.L., Anderson N.G. A two-dimensional gel database of human plasma proteins. // Electrophoresis. 1991. — 12(11). — P. 883−906.
- Anderson N.L., Anderson N.G. The human plasma proteome: history, character, and diagnostic prospects. // Molecular and Cellular Proteomics. 2002. — Vol.1. — № 11. — P. 845−867.
- Anderson N.L. 2010 The clinical plasma proteome: a survey of clinical assays for proteins in plasma ans serum. // Clinical Chemistry. 2010. — № 56. — P. 177−185.
- Anqles-Cano E. Overview on fibrinolysis: plasminogen activation pathways on fibrin and cell surfaces. // Chem. Phys. Lipids. 1994. — 67 — 68. — P. 353 -362.
- Archakov A., Ivanov Y., Lisitsa A., Zgoda V. Biospecific irreversible fishing coupled with atomic force microscopy for detection of extremely low-abundant proteins. // Proteomics. -2009. 9(5). — P. 1326−1343.
- Banfi G., Del Fabbro M. Biological variation in tests of hemostasis. // Seminars in Thrombosis and Hemostasis. 2009. -Vol! 35. — № 1. — P. 120−126.
- Belozerova I.N., Nemirovskaya T.L., Shenkman B.S. et al. Structural and metabolic characteristics of human soleus fibers after long duration spaceflight. // Journal of Gravitational Physiology. 2002. — Vol. 9. — № 1. — P 125−126.
- Belt K.T., Carroll M.C., Perter R.R. The structural basis of the multiple forms of human complement component C4. // Cell. 1984. — 36(4). — P. 907−914.
- Bloomston M., Zhou J.X., Rosemurgy A.S., Frankel W., Muro-Cacho C.A., Yeatman T.J. Fibrinogen gamma overexpression in pancreatic cancer identified by large-scale proteomic analysis of serum samples. // Cancer. Res. 2006. — 66(5). — P. 2592−2599.
- Bowler R. P, Duda B, Chan E.D. et al. Proteomic analysis of pulmonary edema fluid and plasma in patients with acute lung injury. // Am. J. Physiol. Lung Cell. Mol. Physiol. 2004. — 286(6). — P. 1095−1104.
- Bradford M.M. A rapid and sensitive method for the quantitation of microgram quantities of protein utilizing the principle of protein-dye binding. // Anal Biochem. 1976. — May 7.-72.-P. 248−254.
- Bruce C, Chouinard R.A. Jr., Tall A.R. Plasma lipid transfer proteins, high-density lipoproteins, and reverse cholesterol transport. // Annu. Rev. Nutr. 1998. — 18. — P. 297 330.
- Canas B, Lopez-Ferrer D, Ramos-Fernandez A, Camafeita E, Calvo E. Mass spectrometry technologies for proteomics. // Brief. Funct. Genomic. Proteomic. 2006. — 4(4). — P. 295−320.
- Castellino F. J, Ploplis V.A. Structure and function of the plasminogen/plasmin system. // Thromb. Haemost. 2005. — 93(4). — P. 647−654.
- Chauhan A. K, Moore T.L. Presence of plasma complement regulatory proteins clusterin (Apo J) and vitronectin (S40) on circulating immune complexes (CIC). // Clinical and Experimental Immunology. 2006. — 145. — P. 398−406.
- Chen J.-H, Chang Y. W, Yao C.-W. et al. Plasma proteome of severe acute respiratory syndrome analyzed by two-dimensional gel electrophoresis and mass-spectrometry. // PNAS. -2004. -Vol.101. -№ 49. P. 17 039−17 044.
- Chen R, Pan S, Brentnall T.A. et al. Proteomic profiling of pancreatic cancer for biomarker discovery. // Molecular and Cellular Proteomics. 2005. — Vol.4. — № 4. — P. 523−533. Epub 2005 Jan 31.
- Chen Y, Lim B. K, Peh S. C, Abdul-Rahman P. S, Hashim O.H. Profiling of serum and tissue high abundance acute-phase proteins of patients with epithelial and germ line ovarian carcinoma. // Proteome Sci. 2008. — 18. P. 6−20.
- Cho S. Y, Lee E. Y, Lee J.S. et al. Efficient prefractionation of low-abundance proteins in human plasma and construction of a two-dimensional map. // Proteomics. 2005. -5(13). — P. 3386−3396.
- Colantonio D. A, Dunkinson C, Bovenkamp D. A, Van Eyk J.E. Effective removal of albumin from serum. // Proteomics. 2005. — 5. — P. 3831−3835.
- Corzett T.H., Fodor I.K., Choi M.W. et al. Statistical analysis of the experimental variation in the proteomic characterization of human plasma by two-dimensional difference gel electrophoresis. // J. Proteome Res. 2006. — 5(10). — P. 2611−2619.
- Corzett T.H., Fodor I.K., Choi M.W. et al. Statistical analysis of variation in the human plasma proteome. // Journal of biomedicine & biotechnology. 2010. — 258 494. Epub 2010 Jan 14.
- Dodds A.W., Law S.K. The complement component C4 of mammals. // Biochem. J. -1990. 15−265(2). — P. 495−502.
- Domon B., Aebersold R. Mass spectrometry and protein analysis. // Science. 2006. -14−312(5771).-P. 212−217.
- Doolittle R.F. Fibrinogen and fibrin. // Annu. Rev. Biochem. 1984. — 53. — P. 195 229.
- Echan L.A., Tang H.Y., Ali-Khan N., Lee K., Speicher D.W. Depletion of multiple high-abundance proteins improves protein profiling capacities of human serum and plasma. // Proteomics. 2005. — 5. — P. 3292−3303.
- Feng J.T., Liu Y.K., Song H.Y. et al. Heat-shock protein 27: a potential biomarker for hepatocellular carcinoma identified by serum proteome analysis. // Proteomics. 2005. -5(17).-P. 4581−4588.
- Frenkel M.J., Blagrove R.J. Cellulose acetate impregnated with polyacrylamide: a novel medium for electrophoresis. // Analytical Biochemistry. 1978. — Vol.84. — № 2. — P. 583−8.
- Gabay C., Kushner T. Acute-phase proteins and other systemic responses to inflammation. //N. Engl. J. Med. 1999. — 340. — P. 448−454.
- Gazenko O.G., Shulzhenko E.B., Egorov A.D. Cardiovascular changes in prolonged space flights. // Acta physiologica Polonica. 1986. — Vol. 37. — № 2. — P. 53−68.
- Gazenko O.G., Egorov A.D., Ioseliani K.K. et al. Medical problems of manned space flights onboard orbital stations. // Acta Astronautica. 1987. — Vol. 15. — № 9 — P.757−760.
- Gigli I., von Zabern I., Porter R.R. The isolation and structure of C4, the fourth component of human complement. // Biochemistry Journal. 1977. — 165. — P. 439−446.
- Grigoriev A.I., Egorov A.D. The effects of prolonged spaceflights on the human body. // Advances in Space Biology and Medicine. 1991. -№ 1.-P. 1−35.
- Grigoriev, A.I., Egorov, A.D. General mechanisms of the effect of weightlessness on the human body. // In: Goor BS, ed. Advances in space biology and medicine. The Netherlands: JAI Press. 1992. — P. 1- 43.
- Han X., Aslanian A., Yates J.R. 3rd. Mass spectrometry for proteomics. // Curr. Opin. Chem. Biol. -2008. 12(5). — P. 483−490.
- Hanash S. HUPO initiatives relevant to clinical proteomics. // Mol Cell Proteomics. -2004.-3(4).-P. 298−301.
- Harris E.K., DeMets D.L. Biological and analytic components of variation in long-term studies of serum constituents in normal subjects 5. Estimated biological variations in ionized calcium. // Clin Chem. 1971. -17(10). P. 983−987.
- Hortin G., Sviridov D., Anderson N.L. High-abundance polypeptides of the human plasma proteome comprising the top 4 logs of polypeptide abundance. // Clinical Chemistry. 2008. — 54 (10). — P. 1608−1616.
- Hortin G.L. et al. 2010 Introduction: Advances in protein analysis for the clinical laboratory. // Clinical Chemistry. 2010. — № 56(2). — P. 149−151.
- Huang H.L., Stasyk T., Morandell S. et al. Biomarker discovery in breast cancer serum using 2-D differential gel electrophoresis/MALDI-TOF/TOF and data validation bi routine clinical assays. // Electrophoresis. 2006. — 27(8). — P. 1641−1650.
- Hui L., Ge-ge W., Zhiyue L., Yanan G. Association analysis of biological variations in different routinely measured biochemical parameters in healthy subjects. // LABMEDICINE. 2009. — Vol. 40. — № 8. — P. 474−477.
- Hye A., Lynham S., Thambisetty M. et al. Proteome-based plasma biomarkers for Alzheimer’s disease. // Brain. 2006. — 129(11). — P. 3042−3050.
- Jackson D., Craven R.A., Hutson R.C. et al. Proteomic profiling identifies afamin as a potential biomarker for ovarian cancer. // Clin. Cancer Res. 2007. — 13(24). — P. 73 707 379.
- Jenny N.S., Arnold A.M., Kuller L.H. et al. Serum amyloid P and cardiovascular disease in older men and women: Results of cardiovascular health study. // Arterioscler Thromb Vase Biol. 2007. — № 27. — P. 352−358.
- Jiang 1., He L., Fountoulakis M. Comparison of protein precipitation methods for sample preparation prior to proteomic analysis. // Journal of Chromatography. 2004. -1023.-P. 317−320.
- Joo W.A., Sul D., Lee D.Y., et al. Proteomic analysis of plasma proteins of workers exposed to benzene. // Mutation Research. 2004. — Vol.558. — № 1−2. — P. 35−44.
- Kahn S.N., Strony L.P. Impresicion of quantification of serum protein fractions by electrophoresis on cellulose acetate. // Clinical Chemistry. 1986. — Vol.32. — № 2. — P. 356−357.
- Kalenka A., Feldmann R.E. Jr., Otero K., Maurer M.H., Waschke K.F., Fiedler F. Changes in the serum proteome of patients with sepsis and septic shock. // Anesth. Analg. -2006. 103(6).-P. 1522−1526.
- Kaplan A., Savary J. Evaluation of cellulose acetate electrophoresis system for serum protein fractionation. // Clinical Chemistry. 1965. — Vol.11. — № 10. — P. 937−942.
- Kap-Soon N., Do-Youn L., Hak C.J. et al. Protein biomarkers in the plasma of workers occupationally exposed to polycyclic aromatic hydrocarbons. // Proteomics. 2004. -Vol. 4.-№ 11.-P. 3505−3513.
- Klie S., Martens L., Vizcaino J.A. et al. Analyzing large-scale proteomics projects with latent semantic indexing. // J. Proteome Res. 2008. — 7(1). — P. 182−191.
- Konstantinova I.V., Rykova M.P., Lesnyak A.T. et al. Immune changes during long-duration missions //Journal ofleukocyte biology. 1993. — Vol.54. — P. 189−201.
- Kremer A., Schneider R., Terstappen G.C. A bioinformatics perspective on proteomics: data storage, analysis, and integration. // Biosci Rep. 2005. — 25(1−2). — P. 95−106.
- Krogh M., Fernandez C., Teilum M., Bengtsson S., James P. A probabilistic treatment of the missing spot problem in 2D gel electrophoresis experiments. // J Proteome Res. -2007.-6(8).-P. 3335−3343.
- Kuzichkin D.S., Morukov B.V., Markin A.A. et al. Haemostasys system indices during 7-day «dry» immersion. // 30th Annual International Gravitational Physiology Meeting. -Xi'an, China, 2009. P. 48
- Kuzichkin D.S., Morukov B.V., Markin A.A. et al. Cosmonauts haemostasis system indices after long-term and short-term space flights. // 17th IAA Humans in Space Symposium. Moscow, Russia, 2009 — P. 75.
- Laemmli U.K. Cleavage of Structural Proteins during the Assembly of the Head of Bacteriophage T4. // Nature. 1970. — Vol.227. — P.680−685.
- Lapolla A., Brioschi M., Banfi C. et al. On the search for glycated lipoprotein ApoA-I in the plasma of diabetic and nephropathic patients. // J. Mass. Spectrom. 2008. — 43(1). -P. 74−81.
- Leach C.S., Altschuler S.I., Cintron-Trevino N.M. The endocrine and metabolic responses to spaceflight. // Medicine and science in sports and exercise. — 1983. Vol.15. — № 5. — P. 432−440.
- Leach C.S. Biochemical and hematologic changes after short-term space flight. // Microgravity Q. 1992. — Vol. 2. — № 2. — P. 69−75.
- Li X., Gong Y., Wang Y. et al. Comparison of alternative analytical techniques for the characterisation of the human serum proteome in HUPO Plasma Proteome Project. // Proteomics. -2005. 5(13). — P. 3423−3441.
- Liao Q., Zhao L., Chen X., Deng Y., Ding Y. Serum proteome analysis for profiling protein markers associated with carcinogenesis and lymph node metastasis in nasopharyngeal carcinoma. // Clin. Exp. Metastasis. 2008. — 25(4). — P. 465−476.
- Lijnen H.R., Collen D. Mechanisms of physiological fibrinolysis. I I Baillieres Clin Haematol. 1995. — 8(2). — P. 277−290.
- Linkowski P., Spiegel K., Kerkhofs M. et al. Genetic and environmental influences on prolactin secretion during wake and during sleep. // American Journal of Physiology. -1998. Vol. 274, (5 Pt 1). — P. 909−919.
- Ma Y., Peng L., Huang L., Liu W., Zhang P., Qin H. Searching for serum tumor markers for colorectal cancer using a 2-D DIGE approach. // Electrophoresis. 2009. -30(15).-P. 2591−2599.
- Macho L., Kvetnansky R., Vigas M. et al. Effect of space flights on plasma hormone levels in man and in experimental animal. // Acta Astronautica. — 1991. — Vol. 23. — P. 117−121.
- Mahley R.W., Innerarity T.L., Rail S.C. Jr. et al. Plasma lipoproteins: apolipoprotein structure and function. // Journal of Lipid Research. 1984. — Vol. 25. — № 12. — P.1277−1294.
- Mancini G., Carbonara A.O., Heremans J.F. Immunochemical quantitation of antigens by single radial immunodiffusion. // Immunochemistry. 1965. — Vol. 2. — № 3. — P. 235 254.
- Markin A., Strogonova L., Balashov O. et al. The dynamics of blood biochemical parameters in cosmonauts during long-term space flights. // Acta Astronautica. 1998. -Vol.42 (1−8).-P. 247−253.
- Mateos-Caceres P.J., Garcia-Mendez A., Lopez Farre A. et al. Proteomic analysis of plasma from patients during an acute coronary syndrome. // J. Am. Coll. Cardiol. 2004. -44(8).-P. 1578−1583.
- Mayer G., Heinze G., Mischak H., Hellemons M.E., Heerspink H.J., Bakker S.J., de Zeeuw D., Haiduk M., Rossing P., Oberbauer R. Omics-bioinformatics in the context of clinical data. // Methods Mol Biol. 2011. — 719. — P. 479−497.
- Molloy M.P., Brzezinski E.E., Hang J., McDowell M.T., VanBogelen R.A. Overcoming technical variation and biological variation in quantitative proteomics. // Proteomics. -2003.-3(10).-P. 1912−1919.
- Nedelkov D., Kiernan U.A., Niederkofler E.E., Tubbs K.A., Nelson R.W. Population proteomics: the concept, attributes, and potential for cancer biomarker research. // Mol Cell Proteomics. 2006. — 5(10). — P. 1811−1818.
- Nelsestuen G.L., Zhang Y., Martinez M.B. et al., Plasma protein profiling: unique and stable feature of individuals. // Proteomics. 2005. — № 5. — P. 4012−4024.
- Nesvizhskii A.I., Vitek 0., Aebersold R. Analysis and validation of proteomic data generated by tandem mass spectrometry. // Nat. Methods. 2007. № 10. — P. 787−797.
- O’Farrell P.H. High resolution two-dimensional electrophoresis of proteins. // J. Biol. Chem. 1975. — 250(10). — P. 4007−4021.
- Pakharukova N.A., Pastushkova L.Kh., Larina I.V., Grigoriev A.I. Changes of human serum proteome profile during 7-day «dry» immersion. // Acta Astronautica. 2010. -V.68.- P. 1523−1528.
- Palmblad M., Tiss A., Cramer R. Mass spectrometry in clinical proteomics from the present to the future. // Proteomics Clin. Appl. — 2009. — 3. — P. 6−17.
- Penque D. Two-dimensional gel electrophoresis and mass spectrometry for biomarker discovery. // Proteomics Clin. Appl. 2009. — № 3. — P. 155−172.
- Pepys M.B., Dash A.C., Marcham R.E. et al. Comparative clinical study of protein SAP (amyloid P component) and C-reactive protein in serum. // Clin. Exp. Immunol. 1978. -№ 32. — P. 119−124.
- Petrak J., Ivanek R., Toman O. et al. Deja vu in proteomics. A hit parade of repeatedly identified differentially expressed proteins. // Proteomics. 2008. — 8(9). — P. 1744−1749.
- Petricon E.F., Paweletz C.P. Liotta L.A. Clinical application of proteomics: Proteomic pattern diagnostics. // J. Mammary. Gland. Biol. Neoplasia. 2002. — 7. — P. 433−440.
- Petricon E.F., Liotta L.A. The vision for a new diagnostic paradigm. // Clin. Chem. -2003.-49.-P. 1276−1278.
- Preckel D., von Kanel R. Regulation of hemostasis by the sympathetic nervous system: Any contribution to coronary artery disease? // Heartdrug. 2004. — V.4. — № 3. — P. 123 130.
- Rigretti P.G., Boschetti E., Lomas L., Citterio A. Protein equalizer technology: the quest for a democratic proteome. // Proteomics. 2006. — 6. — P. 3980−3992.
- Rogers S. Statistical methods and models for bridging Omics data levels. // Methods Mol Biol.-2011.-719.-P. 133−151.
- Rosenberg L.H., Franzen B., Auer G., Lehtio J., Forshed J. Multivariate meta-analysis of proteomics data from human prostate and colon tumours. // BMC Bioinformatics. -2010, — 17(11).-P. 468.
- Rosenberg M.E., Silkensen J. Clusterin: physiologic and pathophysiologic considerations. // Int J Biochem Cell Biol. 1995. — Jul 27(7). — P. 633−645.
- Sanchez J.C., Appel R.D., Golaz O. et al. Inside SWISS-2DPAGE database. // Electrophoresis. 1995. — 16(7).-P. 1131−1151.
- Schaller J., Gerber S., Kampfel U., Lejon S., Trachsel C. Human blood plasma proteins: Structure and function. // John Wiley & Sons Ltd, England. 2008.
- Schenone N., Furie B.C., Furie B. The blood coagulation cascade. // Curr. Opin. Hematol. 2004. — 11(4). — P. 272−277.
- Scherp P., Ku G., Coleman L., Kheterpal I. Gel-based and gel-free proteomic technologies.//Methods in Molecular Biology.-2011. Vol. 702.-P. 163−189.
- Stein T.P., Gaprindashvili T. Spaceflight and protein metabolism, with special reference to humans. // American Journal of Clinical Nutrition. 1994. — Vol. 60. — № 5. — P. 806 819.
- Stein T.P., Leskiw M.J. Oxidant damage during and after spaceflight. // American journal of physiology. // Endocrinology and metabolism. 2000. — Vol. 278. — № 3. — P. 375−382.
- Stein T.P. Nutrition in the space station era. // Nutrition research reviews. 2001. — Vol. 14. -№ l.-P. 87−118.
- Stein T.P. Space flight and oxidative stress. // Nutrition. 2002. — Vol.18. — № 10. -P. 867−871.
- Stein T.P., Schluter M.D. Plasma protein synthesis after spaceflight. // Aviation Space Environmental Medicine. 2006. — Vol. 77. — № 7. — P. 745- 748.
- Thulasiraman V., Lin S., Gheorghui L. et al. Reduction of the concentration difference of proteins in biological liquids using a library of combinatorial ligands. // Electrophoresis. 2005. — 26. — P. 3561−3571.
- Tipton C.M., Greenleaf J.E., Jackson C.G. Neuroendocrine and immune system responses with spaceflights. // Medicine and science in sports and exercise. 1996. -Vol. 28.-№ 8.-P. 988−998.
- Voss E.W.Jr. Prolonged weightlessness and humoral immunity. // Science. 1984. -Vol. 225. — № 4658. — P. 214−215.
- Wan J., Sun W., Li X. et al. Inflammation inhibitors were remarkably up-regulated in plasma of severe acute respiratory syndrome patients at progressive phase. // Proteomics. 2006. — 6(9). — P. 2886−2894.
- Winkler W., Zellner M., Diestinger M. et al. Biological variation of the platelet proteome in the elderly population and its implication for biomarker research. // Molecular and Cellular Proteomics. 2008. — Vol. 7. — № 1. — P. 193−203.
- Yalow R.S. Radioimmunoassay methodology: application to problems of heterogeneity of peptide hormones. // Pharmacology Review. 1973. — Vol. 25. — № 2. — P. 161−178.
- Yalow R.S. Radioimmunoassay: Practices and pitfalls. // Circulation research. 1973. -Vol. 32,(Suppl 1).-P. 116−128.
- Yalow R.S. Heterogeneity of peptide hormones: Its relevance in clinical radioimmunoassay. // Advances in clinical chemistry 1978. — Vol. 20. — P. 1−47.
- Yalow R.S. Radioimmunoassay // Annual review of biophysics and bioengineering. -1980.-Vol. 9.-P. 327−345.
- Yu M., Wang X.X., Zhang F.R. et al. Proteomic analysis of the serum in patients with idiopathic pulmonary arterial hypertension. // J. Zhejiang. Univ. Sci. B. 2007. — 8(4). -P. 221−227.
- Zhang X., Guo Y., Song Y. et al. Proteomic analysis of individual variation in normal livers of human beings using difference gel electrophoresis. // Proteomics. 2006. — Vol. 6(19).-P. 5260−5268.
- Zolotarjova N, Martosella J, Nicol G. et al. Differences among techniques for high-abundant protein depletion. // Proteomics. 2005. — Aug. 5(13). — P. 3304−3313.1. БЛАГОДАРНОСТИ: