Анализ последовательностей D-петли митохондриальной ДНК (мтДНК). Анализ выявил наличие двух типов митохондриальной ДНК. Среди особей, маркированных как 2-х летние — 24 особи относятся к «русско-сибирскому» гаплотипу, и 7 особей были определены как представители «русского» гаплотипа митохондриальной ДНК. Среди особей, маркированных как 4х-летние, 2 особи имели «русско-сибирский» гаплотип, а остальные (78 особей) — «русский» гаплотип.
Секвенирование мтДНК. В связи с тем, что в каждой возрастной группе наблюдалась гетерогенность по наличию определенного гаплотипа, был проведен анализ нуклеотидной последовательности (секвенирование) контрольного региона мтДНК. Анализ последовательностей подтвердил присутствие всего двух типов нуклеотидных последовательностей этого высокополиморфного региона, соответствующих русскому и русско-сибирскому гаплотипам, причем особи с русским гаплотипом, маркированные как 4-х летние, и особи, маркированные как 2-х-летние, имели идентичную последовательность ДНК. Также идентична была последовательность у особей с «русско-сибирским» гаплотипом, вне зависимости от декларированного возраста. Проведенный анализ позволяет с высокой степенью достоверности сделать вывод, что все особи русского осетра принадлежат к потомству только двух самок — от одной самки получены четырехлетки, от другой — двухлетки.
Анализ полиморфизма по микросателлитным локусам ядерной ДНК. Проведен анализ по пяти микросателлитным локусам. Однако в связи с очевидной близкородственностью выборки статистический анализ проведен по двум локусам, имеющим наибольшее аллельное разнообразие в данных выборках.
На основании анализа электрофореграмм по каждому из локусов были выявлены аллели, характерные для исследуемых особей. Набор аллелей (от 1 до 4) был индивидуален для каждой особи. У отдельных особей этот набор мог совпадать. Также встречались особи, имеющие сходный состав аллелей, но различающиеся по количеству той или иной аллели. Поэтому учитывался так называемый доз-эффект, вычисляемый по различию в интенсивности свечения полос на каждой отдельной дорожке электрофореграммы. Для определения генотипа исследуемых особей было подсчитано количество аллелей по каждому из локусов в отдельности. В каждой возрастной группе (с учетом проведенной коррекции на основании анализа мтДНК) выявлен уровень полиморфизма, характерный для потомков одной пары производителей. То есть, при оплодотворении икры использовалась сперма только одного самца, либо, если использовалась смесь спермы нескольких самцов, то сперма остальных самцов не была фертильна. Таким образом, можно сделать вывод, что представленные для анализа особи в каждой из возрастных групп являются полными сибсами.
